RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 M1APQ8TC57 530 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 OSTF1Q92882 214 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 TMCO6Q96DC7 493 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 DUSP21Q9H596 190 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 IL20Q9NYY1 176 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 TMEM5Q9Y2B1 443 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 DMXL1Q9Y485 3027 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 RAD1O60671 282 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 SLC6A8P48029 635 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 MVKQ03426 396 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 Q0VFX4 171 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 COL28A1Q2UY09 1125 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 GXYLT1Q4G148 440 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 THSD4Q6ZMP0 1018 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 LRRC17Q8N6Y2 441 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 OR5W2Q8NH69 310 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 GGHQ92820 318 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 CDCP1Q9H5V8 836 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 CLN6Q9NWW5 311 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 KLRF1Q9NZS2 232 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 SNX5Q9Y5X3 404 aa20.14■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 MPDZO75970 2070 aa20.13■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 FBXO45P0C2W1 286 aa20.13■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 XAF1Q6GPH4 301 aa20.13■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa20.13■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 SLC2A10O95528 541 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 CD63P08962 238 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 SLC1A3P43003 542 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 P2RX1P51575 399 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 GABREP78334 506 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 SSPNQ14714 243 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 QPRTQ15274 297 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 PGGHGQ32M88 737 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 IL20RBQ6UXL0 311 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 NUP54Q7Z3B4 507 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 SGTBQ96EQ0 304 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 MED11Q9P086 117 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 H3BSA7 217 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 RGS10O43665 173 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 MPZL2O60487 215 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 FADS2O95864 444 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 NAGAP17050 411 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 MASP1P48740 699 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 GAS1P54826 345 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 CBFBQ13951 182 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 CCDC81Q6ZN84 652 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 GPR119Q8TDV5 335 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 NPAS1Q99742 590 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 COPS4Q9BT78 406 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 UBQLN3Q9H347 655 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 METTL7AQ9H8H3 244 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 HHATLQ9HCP6 504 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 WDR70Q9NW82 654 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 SIGLEC7Q9Y286 467 aa20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 CCDC160A6NGH7 325 aa20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 PGCP20142 388 aa20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 PTGDSP41222 190 aa20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 TMED10P49755 219 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 FHL1Q13642 323 aa20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 RAB39AQ14964 217 aa20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 ASCL5Q7RTU5 278 aa20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 OAFQ86UD1 273 aa20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 OR8J1Q8NGP2 316 aa20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 MCCC2Q9HCC0 563 aa20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 P4HTMQ9NXG6 502 aa20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 OSGIN1Q9UJX0 560 aa20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa20.11■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 TERTO14746 1132 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 STSP08842 583 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 ADRA2AP08913 450 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 PNMTP11086 282 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 GP1BBP13224 206 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 NTRK2Q16620 822 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 MRGPREQ86SM8 312 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 IGFN1Q86VF2 1251 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 CLDN22Q8N7P3 220 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 TTC9Q92623 222 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 LRR1Q96L50 414 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 FAM192AQ9GZU8 254 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 ADAM19Q9H013 955 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 IL17BQ9UHF5 180 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 A0A1W2PQ72 361 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 CLCA1A8K7I4 914 aa20.1■□□□□ 0.81
VSX1-205ENST00000429762 PTP4A3O75365 173 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms