RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 POPDC2Q9HBU9 364 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 IL1RAPQ9NPH3 570 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 LZTFL1Q9NQ48 299 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 TAAR2Q9P1P5 351 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 OARD1Q9Y530 152 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 CLIP1P30622 1438 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 YEATS2Q9ULM3 1422 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 TIAM1Q13009 1591 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 CCDC18Q5T9S5 1454 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 A0A0J9YYE9 177 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 SMCO3A2RU48 225 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 G3V2L1 256 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 WWP2O00308 870 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 FBP2O00757 339 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.64e-10■■□□□ 13.9
MDM2-201ENST00000258148 TRMUO75648 421 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 CEACAM4O75871 244 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 TMEM50AO95807 157 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 TRBC1P01850 177 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 CLTAP09496 248 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 ZNF853P0CG23 659 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 FCGR2CP31995 323 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 SSR1P43307 286 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 BCAP31P51572 246 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 LAGE3Q14657 143 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 ZNF77Q15935 545 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 CCDC6Q16204 474 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 KLHL38Q2WGJ6 581 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 GTDC1Q4AE62 458 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.62e-7■□□□□ 10.1
MDM2-201ENST00000258148 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 HPS6Q86YV9 775 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 MICU2Q8IYU8 434 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 DTX3LQ8TDB6 740 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 TBCKQ8TEA7 893 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 FAHD2AQ96GK7 314 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 PANX2Q96RD6 677 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 NT5DC2Q9H857 520 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 ADGRL4Q9HBW9 690 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 ESM1Q9NQ30 184 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 CHRAC1Q9NRG0 131 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 INPP5EQ9NRR6 644 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 TAS2R16Q9NYV7 291 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 CEP162Q5TB80 1403 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 MAP3K19Q56UN5 1328 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa5.05□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 CD8B2A6NJW9 211 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 OR6C65A6NJZ3 312 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 K7ERI5 159 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 INPP4BO15327 924 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 YKT6O15498 198 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 PLCH2O75038 1416 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 OR2J3O76001 311 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 STAG3L2P0CL84 134 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 ACVRL1P37023 503 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 LTBQ06643 244 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 ZNF33BQ06732 778 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 TEX44Q53QW1 395 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 SEL1L2Q5TEA6 688 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 METTL11BQ5VVY1 283 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 C9orf57Q5W0N0 161 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 SLC22A10Q63ZE4 541 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 SASS6Q6UVJ0 657 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 AKNAQ7Z591 1439 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 CCDC50Q8IVM0 306 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 MFSD6LQ8IWD5 586 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 OR2L13Q8N349 312 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 NEUROG1Q92886 237 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 RAB1CQ92928 201 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 KCNA7Q96RP8 456 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 P2RY13Q9BPV8 354 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 FAM173AQ9BQD7 235 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 NEUROG2Q9H2A3 272 aa5.04□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 RHBGQ9H310 441 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.9 ms