RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 DCHS2Q6V1P9 2916 aa16.64■□□□□ 0.25
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PTX4-201ENST00000293922 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa16.63■□□□□ 0.25
PTX4-201ENST00000293922 FAM166BA8MTA8 275 aa16.63■□□□□ 0.25
PTX4-201ENST00000293922 NPIPA7E9PJI5 369 aa16.63■□□□□ 0.25
PTX4-201ENST00000293922 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
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PTX4-201ENST00000293922 DNASE1L1P49184 302 aa16.63■□□□□ 0.25
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PTX4-201ENST00000293922 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa16.62■□□□□ 0.25
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PTX4-201ENST00000293922 RNF220Q5VTB9 566 aa16.62■□□□□ 0.25
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PTX4-201ENST00000293922 TMEM251Q8N6I4 163 aa16.62■□□□□ 0.25
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF407Q9C0G0 2248 aa16.61■□□□□ 0.25
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PTX4-201ENST00000293922 DHRS12A0PJE2 317 aa16.61■□□□□ 0.25
PTX4-201ENST00000293922 PRSS44E7EML9 344 aa16.61■□□□□ 0.25
PTX4-201ENST00000293922 E9PLN8 166 aa16.61■□□□□ 0.25
PTX4-201ENST00000293922 SYT5O00445 386 aa16.61■□□□□ 0.25
PTX4-201ENST00000293922 SCDO00767 359 aa16.61■□□□□ 0.25
PTX4-201ENST00000293922 FADS1O60427 444 aa16.61■□□□□ 0.25
PTX4-201ENST00000293922 TPST1O60507 370 aa16.61■□□□□ 0.25
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