RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 NEK6Q9HC98 313 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 TREX1Q9NSU2 369 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 FAM118AQ9NWS6 357 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 B3GAT1Q9P2W7 334 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 TSPAN16Q9UKR8 245 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ACAD8Q9UKU7 415 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PDE10AQ9Y233 779 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PADI2Q9Y2J8 665 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 AP3M1Q9Y2T2 418 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 HES2Q9Y543 173 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 A0A0J9YYE9 177 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PRB8 838 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CLRN2A0PK11 232 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SLC1A7O00341 560 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SLC7A4O43246 635 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 FGF17O60258 216 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ACHEP22303 614 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 MPZP25189 248 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PSMA3P25788 255 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PKLRP30613 574 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ADRA1AP35348 466 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 TGFBR2P37173 567 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 MAGEA2P43356 314 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 RPS5P46782 204 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SLC26A2P50443 739 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 GNG2P59768 71 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CX3CL1P78423 397 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CRADDP78560 199 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CD47Q08722 323 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 TCP10Q12799 353 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CDH17Q12864 832 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CAMK2DQ13557 499 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CDK10Q15131 360 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 NEDD8Q15843 81 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SMU1Q2TAY7 513 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PYCR3Q53H96 274 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SMUG1Q53HV7 270 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 YIF1BQ5BJH7 314 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 XKR7Q5GH72 579 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ZNF678Q5SXM1 525 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 OR6B2Q6IFH4 312 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PRR27Q6MZM9 219 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 DET1Q7L5Y6 550 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 TMPRSS11BQ86T26 416 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PIGZQ86VD9 579 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SLC22A16Q86VW1 577 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 OFCC1Q8IZS5 231 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 KLHDC9Q8NEP7 349 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 OR52K1Q8NGK4 314 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 RHEBL1Q8TAI7 183 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 RNF139Q8WU17 664 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 BIRC7Q96CA5 298 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SLC47A1Q96FL8 570 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 RNF170Q96K19 258 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 TSNARE1Q96NA8 513 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 NODALQ96S42 347 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 MBOAT4Q96T53 435 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 NPY6RQ99463 290 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 RAD9AQ99638 391 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PITX2Q99697 317 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CCDC32Q9BV29 185 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CHID1Q9BWS9 393 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CAB39LQ9H9S4 337 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 POPDC3Q9HBV1 291 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 Q9N2K0 584 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 MYNNQ9NPC7 610 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 DIABLOQ9NR28 239 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SERINC1Q9NRX5 453 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 AIG1Q9NVV5 245 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CCDC167Q9P0B6 97 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 DNAJB9Q9UBS3 223 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa4.54□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa4.54□□□□□ -1.68
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