RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 CXCL13O43927 109 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 FCMRO60667 390 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 LBPP18428 481 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ATP6V1C1P21283 382 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 EPHA3P29320 983 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 SFTPDP35247 375 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ART1P52961 327 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 C21orf58P58505 322 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 UFM1P61960 85 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 GPR68Q15743 365 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 SGCBQ16585 318 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 KLHL26Q53HC5 615 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 PDZK1Q5T2W1 519 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 C22orf34Q6ZV56 151 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 CDC20BQ86Y33 519 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 METTL25Q8N6Q8 603 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 OR10D3Q8NH80 312 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 FAM222BQ8WU58 562 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 LRRC46Q96FV0 321 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ADGRG7Q96K78 797 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 SLC35G5Q96KT7 338 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ZFP3Q96NJ6 502 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 SDF2Q99470 211 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 OR51I1Q9H343 314 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 MEAF6Q9HAF1 191 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 MKLN1Q9UL63 735 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 AP4B1Q9Y6B7 739 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 MED13LQ71F56 2210 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PQD3 144 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 NTN1O95631 604 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 NUDT14O95848 222 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 CGAP01215 116 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 LINGO3P0C6S8 592 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 OR12D1P0DN82 309 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 EPXP11678 715 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 DDX5P17844 614 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 CCKARP32238 428 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 FUT5Q11128 374 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 GUSBP1Q15486 140 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 SMU1Q2TAY7 513 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 FBXW10Q5XX13 1052 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 ZNF550Q7Z398 422 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 MAVSQ7Z434 540 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 KIF18BQ86Y91 864 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 HOMEZQ8IX15 550 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 ZNF610Q8N9Z0 462 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 OR8J2Q8NGG1 315 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 FBXO27Q8NI29 283 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 TLCD1Q96CP7 247 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 INPP5KQ9BT40 448 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 SRXN1Q9BYN0 137 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 PIGMQ9H3S5 423 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 RNF122Q9H9V4 155 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 TMBIM4Q9HC24 238 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 KLHL28Q9NXS3 571 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 ICAM5Q9UMF0 924 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 F8P00451 2351 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 A0A087WZY1 265 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 SH3D21A4FU49 640 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 LINC01387J3KSC0 135 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 MSTNO14793 375 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 SIAH2O43255 324 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 CYP7B1O75881 506 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 ZNF17P17021 662 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 KLK2P20151 261 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 LCN1P31025 176 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 CDKN2CP42773 168 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 P2RX1P51575 399 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 CCR4P51679 360 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 ATP12AP54707 1039 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 SORDQ00796 357 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 CASP8Q14790 479 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 MAPK14Q16539 360 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-213ENST00000494956 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms