RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 SIAH2O43255 324 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 HCRTR2O43614 444 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 NDUFB5O43674 189 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 SMPD2O60906 423 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 SOX30O94993 753 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 ANGPTL1O95841 491 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 C6orf47O95873 294 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 IL18BPO95998 194 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 KRT16P08779 473 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 EPXP11678 715 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 PEPDP12955 493 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 LBPP18428 481 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 HK1P19367 917 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 TBXA2RP21731 343 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 CTSSP25774 331 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 OPRM1P35372 400 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 PEX19P40855 299 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 CCT3P49368 545 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 STARP49675 285 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 DIO3P55073 304 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 CLDN18P56856 261 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 BST1Q10588 318 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 TP53BP2Q13625 1128 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 BCL2A1Q16548 175 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 PGS1Q32NB8 556 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 SPDYE7PQ495Y7 208 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 RAET1LQ5VY80 246 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 CDC73Q6P1J9 531 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 FIGNL1Q6PIW4 674 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 PRSS57Q6UWY2 283 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 APOOLQ6UXV4 268 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 ZAR1Q86SH2 424 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 GALNT10Q86SR1 603 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRC34Q8IZ02 419 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 MEIOBQ8N635 442 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 COX18Q8N8Q8 333 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 OR4C3Q8NH37 302 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 CDS1Q92903 461 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 MOAP1Q96BY2 351 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 CHMP6Q96FZ7 201 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 C16orf58Q96GQ5 468 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 ZFP3Q96NJ6 502 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 TM9SF2Q99805 663 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 PIGQQ9BRB3 760 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 G6PC3Q9BUM1 346 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 BTBD2Q9BX70 525 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 ACTRT3Q9BYD9 372 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 NUF2Q9BZD4 464 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 ACBD3Q9H3P7 528 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 PIGUQ9H490 435 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 MEAF6Q9HAF1 191 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 UBQLN4Q9NRR5 601 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 VWFP04275 2813 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A087WZY1 265 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1W2PQD3 144 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 OR2M5A3KFT3 312 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 SCDO00767 359 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 RCBTB2O95199 551 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 IFNA2P01563 188 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 HPGDP15428 266 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 ATP6V1C1P21283 382 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 SOAT1P35610 550 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC18A1P54219 525 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 WDR4P57081 412 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 HBA1P69905 142 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 TNK1Q13470 666 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 DPY19L1Q2PZI1 675 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM44Q2T9K0 475 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 DCST2Q5T1A1 773 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 CCNJQ5T5M9 372 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 FBXW10Q5XX13 1052 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 ATG16L1Q676U5 607 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 OR4F3Q6IEY1 312 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 OGFOD2Q6N063 350 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 BHLHB9Q6PI77 547 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 CHMP1BQ7LBR1 199 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 MISPQ8IVT2 679 aa5.78□□□□□ -1.48
CTDSPL-208ENST00000486978 UBQLNLQ8IYU4 475 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms