RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 SWAP70Q9UH65 585 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATG4BQ9Y4P1 393 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLK4Q9Y5K2 254 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa-1.96□□□□□ -2.72
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RNU6-871P-201ENST00000516122 IDSB3KWA1 339 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAD51BO15315 384 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIAA0513O60268 411 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANXA9O76027 345 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNAPINO95295 136 aa-1.96□□□□□ -2.72
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RNU6-871P-201ENST00000516122 GIPP09681 153 aaPredicted RBP-1.96□□□□□ -2.72
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SAA4P35542 130 aa-1.96□□□□□ -2.72
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RNU6-871P-201ENST00000516122 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP-1.96□□□□□ -2.72
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RNU6-871P-201ENST00000516122 PTK6Q13882 451 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 CAMK4Q16566 473 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 NRF1Q16656 503 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-1.96□□□□□ -2.72
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SAP25Q8TEE9 199 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 NXNL1Q96CM4 212 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCAPGQ9BPX3 1015 aa-1.96□□□□□ -2.72
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CHAC1Q9BUX1 264 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB34Q9BZG1 259 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHIAQ9BZP6 476 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCG8Q9H221 673 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00574Q9H8X3 128 aa-1.96□□□□□ -2.72
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RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF226Q9NYT6 803 aa-1.96□□□□□ -2.72
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SESN1Q9Y6P5 492 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALPK2Q86TB3 2170 aa-1.97□□□□□ -2.72
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RNU6-871P-201ENST00000516122 C19orf81C9J6K1 198 aa-1.97□□□□□ -2.72
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RNU6-871P-201ENST00000516122 H7C417 338 aa-1.97□□□□□ -2.72
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RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP-1.97□□□□□ -2.72
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC9A3R2Q15599 337 aa-1.97□□□□□ -2.72
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SARM1Q6SZW1 724 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 MOXD1Q6UVY6 613 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPINK6Q6UWN8 80 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 LCA10Q71F78 164 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHST3Q7LGC8 479 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF645Q8N7E2 425 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXO25Q8TCJ0 367 aa-1.97□□□□□ -2.72
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RNU6-871P-201ENST00000516122 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 CKAP2Q8WWK9 683 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATL1Q8WXF7 558 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 PGAM5Q96HS1 289 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF665Q9H7R5 613 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZFP14Q9HCL3 533 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 STK26Q9P289 416 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 MBD2Q9UBB5 411 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 BTNL2Q9UIR0 455 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATG2BQ96BY7 2078 aa-1.97□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 COL4A2P08572 1712 aa-1.97□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ESYT2A0FGR8 921 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 SIGLEC16A6NMB1 481 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 E9PLD3 99 aa-1.98□□□□□ -2.73
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