RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473186.5

KMT2C-208, Transcript of lysine methyltransferase 2C, human

TSL 1 (best)

Gene KMT2C, Length 12,854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KMT2C-208	ENST00000473186	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	UBA7	P41226	1012 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SAMM50	Q9Y512	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PTPRK	Q15262	1439 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	OGFOD1	Q8N543	542 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	NSD2	O96028	1365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PPP1R2	P41236	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	NLRP5	P59047	1200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SNX16	P57768	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	FAM193A	P78312	1265 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	GRIN2A	Q12879	1464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SIL1	Q9H173	461 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CABP1	Q9NZU7	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	STK3	Q13188	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	KRT23	Q9C075	422 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186		A6NNZ2	444 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	GMNN	O75496	209 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	GAS8	O95995	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PRC1	O43663	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ESPN	B1AK53	854 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CASQ1	P31415	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PRDM2	Q13029	1718 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	IVL	P07476	585 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CALM1	P0DP23	149 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CALM2	P0DP24	149 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CALM3	P0DP25	149 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	KRT13	P13646	458 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63	3e-6	■■□□□ 12.7
KMT2C-208	ENST00000473186	AKR1B10	O60218	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SLC8A3	P57103	927 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63	3e-6	■□□□□ 10.6
KMT2C-208	ENST00000473186	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC102B	Q68D86	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PSMA7	O14818	248 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KMT2C-208	ENST00000473186	HSPA4	P34932	840 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KMT2C-208	ENST00000473186	STX1A	Q16623	288 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KMT2C-208	ENST00000473186	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		4.84	□□□□□ -1.64

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