RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIRPAP78324 504 aa23.6■■□□□ 1.37
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM27E3Q08E93 113 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCLAFQ15004 111 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRAMD1BQ3KR37 738 aa23.6■■□□□ 1.37
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOOLQ6UXV4 268 aa23.59■■□□□ 1.37
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EXOC3L1Q86VI1 746 aa23.59■■□□□ 1.37
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AP4B1Q9Y6B7 739 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCNX3Q9H6A9 2034 aa23.59■■□□□ 1.37
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KANK2Q63ZY3 851 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLHC1Q8NHS4 586 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FNDC9Q8TBE3 224 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NTMQ9P121 344 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMED5Q9Y3A6 229 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PPR1 153 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EMC8O43402 210 aa23.57■■□□□ 1.36
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GALNT10Q86SR1 603 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOMEZQ8IX15 550 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MS4A4EQ96PG1 132 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC39A3Q9BRY0 314 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HHATLQ9HCP6 504 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STOML1Q9UBI4 398 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS13CQ709C8 3753 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHISA8B8ZZ34 492 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALG1L2C9J202 215 aa23.56■■□□□ 1.36
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OCRLQ01968 901 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGCBQ16585 318 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GALNTL6Q49A17 601 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDIASQ8IXT1 998 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL25Q8N6Q8 603 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4C3Q8NH37 302 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO30Q8TB52 745 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTERF3Q96E29 417 aa23.56■■□□□ 1.36
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEUROD4Q9HD90 331 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL28Q9NXS3 571 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELOVL5Q9NYP7 299 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VDAC3Q9Y277 283 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLDC2A0PJX2 215 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTIFO43310 598 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFB5O43674 189 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NGFRP08138 427 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACP2P11117 423 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCGR2AP12318 317 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POU2F1P14859 743 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOSL1P15407 271 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD53P19397 219 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC16A11Q8NCK7 471 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR6Y1Q8NGX8 325 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOPT1Q96IL0 206 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MED18Q9BUE0 208 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLL4Q9NR61 685 aa23.55■■□□□ 1.36
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