RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 SMPDL3BQ92485 455 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 OMA1Q96E52 524 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 MARK4Q96L34 752 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 Q96MF0 132 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 GPR78Q96P69 363 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC1Q9BTT6 524 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 SFXN3Q9BWM7 321 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 OSBPL11Q9BXB4 747 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ITPAQ9BY32 194 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 OR2B2Q9GZK3 357 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 DPH5Q9H2P9 285 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 METTL7AQ9H8H3 244 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 NMRAL1Q9HBL8 299 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 GRHL1Q9NZI5 618 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 MAT2BQ9NZL9 334 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF639Q9UID6 485 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 FBXL2Q9UKC9 423 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
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HOXD8-202ENST00000429017 H0Y3Z8 333 aa5.92□□□□□ -1.46
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HOXD8-202ENST00000429017 OR7A17O14581 309 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 HCRTR2O43614 444 aa5.92□□□□□ -1.46
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HOXD8-202ENST00000429017 PIK3R1P27986 724 aa5.92□□□□□ -1.46
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HOXD8-202ENST00000429017 CLDN15P56746 228 aa5.92□□□□□ -1.46
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HOXD8-202ENST00000429017 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.92□□□□□ -1.46
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HOXD8-202ENST00000429017 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 MAP4K2Q12851 820 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 GTF2H2Q13888 395 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 RCAN2Q14206 197 aa5.92□□□□□ -1.46
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HOXD8-202ENST00000429017 TRADDQ15628 312 aa5.92□□□□□ -1.46
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HOXD8-202ENST00000429017 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 GRTP1Q5TC63 336 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa5.92□□□□□ -1.46
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 RAPH1Q70E73 1250 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 NUP54Q7Z3B4 507 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 NUDT13Q86X67 352 aa5.92□□□□□ -1.46
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HOXD8-202ENST00000429017 CDKL2Q92772 493 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 UBE2FQ969M7 185 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 STARD4Q96DR4 205 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 CENPKQ9BS16 269 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 RAB17Q9H0T7 212 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 IPPKQ9H8X2 491 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ACTR8Q9H981 624 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRA2Q9H9E1 313 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 KLHL28Q9NXS3 571 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 PSD3Q9NYI0 1048 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 HEY2Q9UBP5 337 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 PLLPQ9Y342 182 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 PRAMEF25A6NGN4 478 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 INAFM1C9JVW0 142 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 H0YC42 278 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ZIC3O60481 467 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 SMPD2O60906 423 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 CBR3O75828 277 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 C2P06681 752 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 PORP16435 677 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF708P17019 499 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 NAGAP17050 411 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 CPOXP36551 454 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 FEN1P39748 380 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 CPA2P48052 419 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 EMDP50402 254 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 GAS1P54826 345 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 NRG3P56975 720 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 HMGCS1Q01581 520 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 SLC7A5Q01650 507 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 GUCY2DQ02846 1103 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 PLCXD2Q0VAA5 305 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
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