RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 OR1E3Q8WZA6 343 aa11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 NEURL3Q96EH8 262 aa11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 MYADMQ96S97 322 aa11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 NDEL1Q9GZM8 345 aa11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 PELI2Q9HAT8 420 aa11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 MYLKQ15746 1914 aa11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 DNAJB5O75953 348 aa11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 BSGP35613 385 aa11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 BIKQ13323 160 aa11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.523e-12■□□□□ 9.9
UBXN4-201ENST00000272638 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 TBC1D25Q3MII6 688 aa11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 ZFP69Q49AA0 526 aa11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 ANKRD54Q6NXT1 300 aa11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 EGFL6Q8IUX8 553 aa11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 TANKQ92844 425 aa11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 SLC22A18Q96BI1 424 aa11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1W2PRG6 482 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 AGAP5A6NIR3 686 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 CLEC3AO75596 197 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 PORP16435 677 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 MAGEA2P43356 314 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 GZMMP51124 257 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 PRSS53Q2L4Q9 553 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 GXYLT1Q4G148 440 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 SLC36A4Q6YBV0 504 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 Q6ZSR6 202 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 NKAIN4Q8IVV8 208 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 LAX1Q8IWV1 398 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 NEIL3Q8TAT5 605 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF221Q9UK13 617 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 I3L1I5 382 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 NARSO43776 548 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 AHCYP23526 432 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 OPRD1P41143 372 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF793Q6ZN11 406 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 USP53Q70EK8 1073 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 ZER1Q7Z7L7 766 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 CSNK1A1LQ8N752 337 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 OR2A1Q8NGT9 310 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 OR8D2Q9GZM6 311 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 SEC14L4Q9UDX3 406 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 TRAV27A0A087WT01 109 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 CHRM4P08173 479 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 PYCR1P32322 319 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 TNFSF8P32971 234 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 PDX1P52945 283 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 RTL4Q6ZR62 310 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 ABHD13Q7L211 337 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 KLHL36Q8N4N3 616 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 SLC41A3Q96GZ6 507 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 CD93Q9NPY3 652 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 ANKRD36A6QL64 1941 aa11.79□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 NPC1O15118 1278 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 PIP5K1CO60331 668 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 SEMA3DO95025 777 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 MYL9P24844 172 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 KCNJ5P48544 419 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 EPHA5P54756 1037 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 ENTPD8Q5MY95 495 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 PGBD2Q6P3X8 592 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 ABHD17CQ6PCB6 329 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 MCUBQ9NWR8 336 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 GDE1Q9NZC3 331 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 HCN2Q9UL51 889 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 SLITRK5O94991 958 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 SLC2A10O95528 541 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 GSTM3P21266 225 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 FAHD1Q6P587 224 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 IL20RBQ6UXL0 311 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 FRRS1Q6ZNA5 592 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 OAFQ86UD1 273 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 IZUMO1Q8IYV9 350 aa11.78□□□□□ -0.52
UBXN4-201ENST00000272638 OR4K13Q8NH42 304 aa11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms