RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588552.5

PTPRS-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRS, Length 5,443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-206ENST00000588552 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 OR52E2Q8NGJ4 325 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 TESCQ96BS2 214 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 PINK1Q9BXM7 581 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ETAA1Q9NY74 926 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 BMP2P12643 396 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 DCKP27707 260 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 PTGER1P34995 402 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ADAM15Q13444 863 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 CCDC80Q76M96 950 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 EID2Q8N6I1 236 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 MFSD9Q8NBP5 474 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 CTBP2P56545 445 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ZNF304Q9HCX3 659 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ARMC1Q9NVT9 282 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 BAIAP2Q9UQB8 552 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 MAZP56270 477 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 MICAQ29983 383 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 AKIRIN2Q53H80 203 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 SLC7A7Q9UM01 511 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 A0A0X1KG70 313 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 MITFO75030 526 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 JRKO75564 520 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 UGT2B7P16662 529 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 OR14L1PQ8NHC6 308 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 CDS1Q92903 461 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 WBP2Q969T9 261 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 RIMS3Q9UJD0 308 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 H0YGG7 62 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 KDM4BO94953 1096 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 MT-ND2P03891 347 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 STSP08842 583 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 CTGFP29279 349 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 HS3ST5Q8IZT8 346 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 TAMM41Q96BW9 452 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 TCTN2Q96GX1 697 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 CMAHPQ9Y471 501 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 OR7A17O14581 309 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 IGLV3-25P01717 112 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 SEC23BQ15437 767 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 PLPP6Q8IY26 295 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 OR4K13Q8NH42 304 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-206ENST00000588552 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 FMO6PO60774 539 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 RAB39AQ14964 217 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 DCST2Q5T1A1 773 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 VRK3Q8IV63 474 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 BIRC8Q96P09 236 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 A0A1W2PPW3 197 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 OSMP13725 252 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 GRPRP30550 384 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 PYCR1P32322 319 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 TRAM1Q15629 374 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 METTL4Q8N3J2 472 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 LAMB2P55268 1798 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 H0YIV9 168 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 ACOT7O00154 380 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 PPP1R3BQ86XI6 285 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 MSLNLQ96KJ4 702 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 WBP1LQ9NX94 342 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 IL20RAQ9UHF4 553 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 ZNF639Q9UID6 485 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-206ENST00000588552 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.5 ms