RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474025.1

SNRNP40-204, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 3

Gene SNRNP40, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-204	ENST00000474025	ATP6V0D1	P61421	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	SIRPA	P78324	504 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	HMGCS1	Q01581	520 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	POU4F1	Q01851	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	MGAT2	Q10469	447 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	VEZF1	Q14119	521 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	ETFDH	Q16134	617 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	FIG4	Q92562	907 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	EXT2	Q93063	718 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	LRRC39	Q96DD0	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	PBK	Q96KB5	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	REG4	Q9BYZ8	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	RNF122	Q9H9V4	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	OPTC	Q9UBM4	332 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	CAD	P27708	2225 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	C17orf51	A8MQB3	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025		H0YC42	278 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025		H0YIV9	168 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	OVOL3	O00110	214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	UBXN8	O00124	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	T	O15178	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	TP73	O15350	636 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	KERA	O60938	352 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	SEMA3D	O95025	777 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	CBX7	O95931	251 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	ATP1B1	P05026	303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	CPM	P14384	443 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	EPB42	P16452	691 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	NT5E	P21589	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	TBXA2R	P21731	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	GRK2	P25098	689 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	DPP4	P27487	766 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	THBS2	P35442	1172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	XK	P51811	444 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	GAS1	P54826	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	RAB10	P61026	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	DUSP2	Q05923	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	CUL3	Q13618	768 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	ISCA2	Q86U28	154 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	NUDT13	Q86X67	352 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-204	ENST00000474025	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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