RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP13.52□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 HGDQ93099 445 aa13.52□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 FBXW5Q969U6 566 aa13.52□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 TMCO6Q96DC7 493 aa13.52□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 GRIP2Q9C0E4 1043 aa13.52□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 RNF122Q9H9V4 155 aa13.52□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa13.52□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 SNX8Q9Y5X2 465 aa13.52□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 AIFM1O95831 613 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 PLAUP00749 431 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 TGFB1P01137 390 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 DANCRP0C864 163 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 PYGBP11216 843 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 FCGR2AP12318 317 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 DEKP35659 375 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 RAP1GDS1P52306 607 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 MED27Q6P2C8 311 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 FAM214BQ7L5A3 538 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 SNX31Q8N9S9 440 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 RDH11Q8TC12 318 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 DOK4Q8TEW6 326 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 CERS2Q96G23 380 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 HS6ST2Q96MM7 605 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 NGBQ9NPG2 151 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 WHRNQ9P202 907 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 LIPT1Q9Y234 373 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 GPR52Q9Y2T5 361 aa13.51□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 UQCRHLA0A096LP55 91 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 PRAMEF25A6NGN4 478 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 PRAMEF4O60810 478 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 ADAM11O75078 769 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 NR2F6P10588 404 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 CD22P20273 847 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 IL11P20809 199 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 PIK3R1P27986 724 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 PTGDSP41222 190 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 PIK3CBP42338 1070 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 SIRPAP78324 504 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 VLDLRP98155 873 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 CHIT1Q13231 466 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 TSNQ15631 228 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 NRF1Q16656 503 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 TMEM249Q2WGJ8 235 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 PRR22Q8IZ63 422 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 NAT8LQ8N9F0 302 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 NODALQ96S42 347 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 GALNT9Q9HCQ5 603 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 HEY2Q9UBP5 337 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 DKKL1Q9UK85 242 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 RNF115Q9Y4L5 304 aa13.5□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 TAPBPO15533 448 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 IGHV4-39P01824 125 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 SOD3P08294 240 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 GPX3P22352 226 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 PGGT1BP53609 377 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 HMGCS1Q01581 520 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 GUSBP1Q15486 140 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 OR52E8Q6IFG1 317 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 CYP20A1Q6UW02 462 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 BEND4Q6ZU67 534 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 EXOC3L1Q86VI1 746 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 OR7G3Q8NG95 312 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 OR6K3Q8NGY3 331 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 OMA1Q96E52 524 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 HDHD5Q9BXW7 423 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 OR51B5Q9H339 312 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 POPDC3Q9HBV1 291 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 EMC9Q9Y3B6 208 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 ASB4Q9Y574 426 aa13.49□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 A0A1W2PP18 115 aa13.48□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 A0A1W2PR48 441 aa13.48□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 C2orf72A6NCS6 295 aa13.48□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 OR6C70A6NIJ9 312 aa13.48□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 SAP18O00422 153 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 ZIC3O60481 467 aa13.48□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 PGRP06401 933 aa13.48□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 CD3EP07766 207 aa13.48□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 PCNAP12004 261 aa13.48□□□□□ -0.25
NELFE-204ENST00000436289 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms