RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 SLC35E2P0CK97 266 aa16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 PORP16435 677 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 MAOAP21397 527 aa16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 MPIP34949 423 aa16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 FEN1P39748 380 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 TRPC1P48995 793 aa16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 ID2Q02363 134 aa16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 DUSP2Q05923 314 aa16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 STX4Q12846 297 aa16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 SERTAD2Q14140 314 aa16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 PSMA8Q8TAA3 256 aa16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 HAS2Q92819 552 aa16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 INPP5KQ9BT40 448 aa16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 NECTIN3Q9NQS3 549 aa16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 PLA2G3Q9NZ20 509 aa16.97■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 A0A096LPI6 279 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 RFXANKO14593 260 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 ERN1O75460 977 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 C6orf47O95873 294 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 NPPAP01160 153 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 ATP1B1P05026 303 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 PTPN6P29350 595 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 TNFSF10P50591 281 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
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PTX4-201ENST00000293922 BTBD16Q32M84 506 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 SFT2D3Q587I9 215 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 C6orf10Q5SRN2 563 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 LRIF1Q5T3J3 769 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 DLEU7Q6UYE1 221 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 HACD2Q6Y1H2 254 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 CCDC116Q8IYX3 515 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 ROPN1LQ96C74 230 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 PTCHD1Q96NR3 888 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 PANX1Q96RD7 426 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 NEUROD4Q9HD90 331 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 TAS2R9Q9NYW1 312 aa16.96■□□□□ 0.31
PTX4-201ENST00000293922 MAST4O15021 2626 aa16.96■□□□□ 0.31
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PTX4-201ENST00000293922 KCNH1O95259 989 aa16.96■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 ZCCHC18P0CG32 403 aa16.96■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 NUDT2P50583 147 aa16.96■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 SPRED3Q2MJR0 410 aa16.96■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 H3F3CQ6NXT2 135 aa16.96■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 PHF12Q96QT6 1004 aa16.96■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 SLAMF8Q9P0V8 285 aa16.96■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 PCDHGB4Q9UN71 923 aa16.96■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 ESPL1Q14674 2120 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 B2RBV5 119 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 WDPCPO95876 746 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 F10P00742 488 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 KRT16P08779 473 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 IFI6P09912 130 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 GALNSP34059 522 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 STT3AP46977 705 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 OR4D2P58180 307 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 PLIN5Q00G26 463 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 ART3Q13508 389 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 EXT1Q16394 746 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 DHDDSQ86SQ9 333 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 OR4A15Q8NGL6 344 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 OR1N1Q8NGS0 311 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 FBXO27Q8NI29 283 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 M1APQ8TC57 530 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 LRRC58Q96CX6 371 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 LPAR4Q99677 370 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 RNF32Q9H0A6 362 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 C1orf21Q9H246 121 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 MMP25Q9NPA2 562 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 GID8Q9NWU2 228 aa16.95■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa16.94■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 A8MUI8 341 aa16.94■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 SLITRK5O94991 958 aa16.94■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 CPOXP36551 454 aa16.94■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 CDK9P50750 372 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 HSPB3Q12988 150 aa16.94■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 FHL5Q5TD97 284 aa16.94■□□□□ 0.3
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