RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 SLC28A1O00337 649 aa28.3■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 CHEK2O96017 543 aa28.3■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 P04436 131 aa28.3■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 CCL3P10147 92 aa28.3■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 PER3P56645 1201 aa28.3■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 PLGLB1Q02325 96 aa28.3■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 MGAT2Q10469 447 aa28.3■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 MAP4K2Q12851 820 aa28.3■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 KANK2Q63ZY3 851 aa28.3■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 GHDCQ8N2G8 530 aa28.3■■■□□ 2.12
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INO80B-201ENST00000233331 ZIM3Q96PE6 472 aa28.3■■■□□ 2.12
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INO80B-201ENST00000233331 CCL27Q9Y4X3 112 aa28.3■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 WIPF3A6NGB9 483 aa28.29■■■□□ 2.12
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INO80B-201ENST00000233331 CNR1P21554 472 aa28.29■■■□□ 2.12
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INO80B-201ENST00000233331 FAM47EQ6ZV65 393 aa28.29■■■□□ 2.12
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INO80B-201ENST00000233331 FAM76AQ8TAV0 307 aa28.29■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 TP53INP1Q96A56 240 aa28.29■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 EHD3Q9NZN3 535 aa28.29■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 A1L4Q6 167 aa28.28■■■□□ 2.12
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INO80B-201ENST00000233331 SEC22BO75396 215 aa28.28■■■□□ 2.12
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INO80B-201ENST00000233331 NOXRED1Q6NXP6 359 aa28.28■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 CCDC116Q8IYX3 515 aa28.28■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
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INO80B-201ENST00000233331 FAM173AQ9BQD7 235 aa28.28■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 LRTM1Q9HBL6 345 aa28.28■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 MYNNQ9NPC7 610 aa28.28■■■□□ 2.12
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INO80B-201ENST00000233331 ICE1Q9Y2F5 2266 aa28.27■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa28.27■■■□□ 2.12
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INO80B-201ENST00000233331 TMEM233B4DJY2 109 aa28.27■■■□□ 2.12
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INO80B-201ENST00000233331 GPX3P22352 226 aa28.27■■■□□ 2.12
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INO80B-201ENST00000233331 OR10G3Q8NGC4 313 aa28.27■■■□□ 2.12
INO80B-201ENST00000233331 ADIPOR1Q96A54 375 aa28.27■■■□□ 2.12
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INO80B-201ENST00000233331 C1orf109Q9NX04 203 aa28.27■■■□□ 2.12
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INO80B-201ENST00000233331 DTX4Q9Y2E6 619 aa28.27■■■□□ 2.12
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INO80B-201ENST00000233331 GP1BBP13224 206 aa28.26■■■□□ 2.11
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INO80B-201ENST00000233331 PPIAP62937 165 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
INO80B-201ENST00000233331 DUSP8Q13202 625 aa28.26■■■□□ 2.11
INO80B-201ENST00000233331 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
INO80B-201ENST00000233331 SH2D4BQ5SQS7 431 aa28.26■■■□□ 2.11
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INO80B-201ENST00000233331 TICAM1Q8IUC6 712 aa28.26■■■□□ 2.11
INO80B-201ENST00000233331 DDIASQ8IXT1 998 aa28.26■■■□□ 2.11
INO80B-201ENST00000233331 OR52R1Q8NGF1 315 aa28.26■■■□□ 2.11
INO80B-201ENST00000233331 OR5M3Q8NGP4 307 aa28.26■■■□□ 2.11
INO80B-201ENST00000233331 OR9A2Q8NGT5 310 aa28.26■■■□□ 2.11
INO80B-201ENST00000233331 OR2T11Q8NH01 316 aa28.26■■■□□ 2.11
INO80B-201ENST00000233331 AGR3Q8TD06 166 aa28.26■■■□□ 2.11
INO80B-201ENST00000233331 ZNF675Q8TD23 568 aa28.26■■■□□ 2.11
INO80B-201ENST00000233331 PAQR8Q8TEZ7 354 aa28.26■■■□□ 2.11
INO80B-201ENST00000233331 TWIST2Q8WVJ9 160 aa28.26■■■□□ 2.11
INO80B-201ENST00000233331 CTHRC1Q96CG8 243 aa28.26■■■□□ 2.11
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