RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 TNFSF10P50591 281 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 ERVK-8P63133 956 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 RNF4P78317 190 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 DUSP2Q05923 314 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 TUBA3CQ13748 450 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 C6orf136Q5SQH8 315 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 TUBA3EQ6PEY2 450 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 GALNT12Q8IXK2 581 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 C19orf60Q96EN9 201 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 EGLN2Q96KS0 407 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 EPN3Q9H201 632 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 SLAMF7Q9NQ25 335 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 PNPOQ9NVS9 261 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 THAP1Q9NVV9 213 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 TAS2R7Q9NYW3 318 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 ERVK-19Q9WJR5 959 aa13.59□□□□□ -0.23
TSTA3-208ENST00000528920 NBASA2RRP1 2371 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 TRAV17A0A0B4J275 112 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 TTLL8A6PVC2 850 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 FCHO1O14526 889 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 KLF11O14901 512 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 ITGA10O75578 1167 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 CT62P0C5K7 136 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 BCKDHAP12694 445 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 CD96P40200 585 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 HK2P52789 917 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 MGAT2Q10469 447 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 FUT7Q11130 342 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 MAP4K2Q12851 820 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 CEBPEQ15744 281 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 HSP90B2PQ58FF3 399 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 FAM180BQ6P0A1 224 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 TICAM1Q8IUC6 712 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 OR5L2Q8NGL0 311 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 TUBGCP3Q96CW5 907 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 MIEF1Q9NQG6 463 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 GIMAP4Q9NUV9 329 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 MYOTQ9UBF9 498 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 ENTPD4Q9Y227 616 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 SHANK1Q9Y566 2161 aa13.58□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 OR6C76A6NM76 312 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 CLPSP04118 112 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 S1PR1P21453 382 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 MAPK1P28482 360 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 SSTR4P31391 388 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 ASMTP46597 345 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 ST13P50502 369 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 HLCSP50747 726 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 SLC37A1P57057 533 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 PPP2R2AP63151 447 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 OCRLQ01968 901 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 PRSS53Q2L4Q9 553 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 C6orf163Q5TEZ5 329 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 FAM111BQ6SJ93 734 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 RNF111Q6ZNA4 994 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 C9orf40Q8IXQ3 194 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC116Q8IYX3 515 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 VWA5B2Q8N398 1253 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 MDS2Q8NDY4 140 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 NUBPLQ8TB37 319 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 TSSK3Q96PN8 268 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 ANKRD10Q9NXR5 420 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 MAT2BQ9NZL9 334 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF639Q9UID6 485 aa13.57□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 MYO1GB0I1T2 1018 aa13.56□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 WWP2O00308 870 aa13.56□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 TBX19O60806 448 aa13.56□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 PRAMEF2O60811 474 aa13.56□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 OR2J2O76002 312 aa13.56□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 PRPS2P11908 318 aa13.56□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 MPIP34949 423 aa13.56□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 PTGER1P34995 402 aa13.56□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 SOX18P35713 384 aa13.56□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 CYB561P49447 251 aa13.56□□□□□ -0.24
TSTA3-208ENST00000528920 SSR4P51571 173 aa13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms