RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 FGF4P08620 206 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 MYZAPP0CAP1 466 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.076e-28■■□□□ 12.8
ACTB-206ENST00000443528 CD96P40200 585 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 MLF1P58340 268 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 PLIN5Q00G26 463 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TUBA3CQ13748 450 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 CASP8Q14790 479 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZNF750Q32MQ0 723 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SPDYAQ5MJ70 313 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 NUDCD3Q8IVD9 361 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 DOK4Q8TEW6 326 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZNF721Q8TF20 911 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 C19orf60Q96EN9 201 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 OR8D2Q9GZM6 311 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TMBIM4Q9HC24 238 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TENM4Q6N022 2769 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 C1orf226A1L170 272 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 WDR91A4D1P6 747 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZFAND5O76080 213 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZWINTO95229 277 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 IGKV3-11P04433 115 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SLC35E2P0CK97 266 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 COX7A2P14406 83 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 PIK3R1P27986 724 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SERPINB5P36952 375 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 IMPG1Q17R60 797 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 Q6ZSR9 355 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 OR2T11Q8NH01 316 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 EBPLQ9BY08 206 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.072e-23■■■□□ 15.6
ACTB-206ENST00000443528 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ABI3Q9P2A4 366 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 HEY2Q9UBP5 337 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 NPIPB8E9PQR5 432 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SLC28A1O00337 649 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 BIRC5O15392 142 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ITM2AO43736 263 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 OR10H2O60403 315 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 IL3P08700 152 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 PRPH2P23942 346 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 GALNSP34059 522 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 XKP51811 444 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 KIAA0040Q15053 153 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 HSDL2Q6YN16 418 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 CLYBLQ8N0X4 340 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 MDS2Q8NDY4 140 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 AGR3Q8TD06 166 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TLCD1Q96CP7 247 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 FBXL20Q96IG2 436 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 CDK2AP1O14519 115 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 PRAMEF2O60811 474 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ITGA10O75578 1167 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 NEURL1O76050 574 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 WISP1O95388 367 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 CLPSP04118 112 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 CT62P0C5K7 136 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 LINC00032P0C843 101 aa14.6□□□□□ -0.07
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