RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 ECSCRQ19T08 205 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF165Q6ZSG1 346 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 AACSQ86V21 672 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 DUSP18Q8NEJ0 188 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 BEST4Q8NFU0 473 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR10H4Q8NGA5 316 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR51G1Q8NGK1 321 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC107Q8WV48 283 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 NXPE2Q96DL1 559 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR10C1Q96KK4 312 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 CEP170P1Q96L14 293 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 NABP2Q9BQ15 211 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSPB9Q9BQS6 159 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTYH2Q9BSA4 534 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 DPAGT1Q9H3H5 408 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 SP140LQ9H930 580 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBQLN2Q9UHD9 624 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDH9Q9ULB4 789 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 ITM2BQ9Y287 266 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 DOCK10Q96BY6 2186 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 SOCS1O15524 211 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBED4O75132 1171 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPAG7O75391 227 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 P4HA1P13674 534 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD27P26842 260 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD1BP29016 333 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 XCR1P46094 333 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 MELKQ14680 651 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 GID4Q8IVV7 300 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2C3Q8N628 320 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF461Q8TAF7 563 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAET1EQ8TD07 263 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 C7orf33Q8WU49 177 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIF1BPQ96EK5 621 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 LURAP1Q96LR2 239 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 NEDD4LQ96PU5 975 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANGPTL4Q9BY76 406 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q9H3A6 140 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCLRE1BQ9H816 532 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 GGA3Q9NZ52 723 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPG21Q9NZD8 308 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 SDK1Q7Z5N4 2213 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 FEZF1A0PJY2 475 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC15A5A6NIM6 579 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 H3BQ06 376 aaPredicted RBP-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARPC2O15144 300 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 TK1P04183 234 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC159P0C7I6 412 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYP11B1P15538 503 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDGFRAP16234 1089 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPBWR1P48145 328 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC26A2P50443 739 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 PNLIPRP2P54317 469 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 UFM1P61960 85 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP2R2BQ00005 443 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 SUSD4Q5VX71 490 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXW8Q8N3Y1 598 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 MOSPD2Q8NHP6 518 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC26Q8TAB7 109 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 BLNKQ8WV28 456 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 POMGNT1Q8WZA1 660 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 SDCCAG3Q96C92 435 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 DACH2Q96NX9 599 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR6C1Q96RD1 312 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL12RB2Q99665 862 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 RETNLBQ9BQ08 111 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 FEM1AQ9BSK4 669 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 GKN1Q9NS71 199 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCB8Q9NUT2 735 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBC1D13Q9NVG8 400 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 MLXQ9UH92 298 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 S4R3C0 116 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 GBF1Q92538 1859 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A0G2JN53 185 aa-1.58□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138.1 ms