RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 ARSFP54793 590 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 HYAL2Q12891 473 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 IMPG1Q17R60 797 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 ADPRMQ3LIE5 342 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 TTLL10Q6ZVT0 673 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 OR4N4Q8N0Y3 316 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 NT5CQ8TCD5 201 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 SLC13A3Q8WWT9 602 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 TUBGCP3Q96CW5 907 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 OR52B2Q96RD2 323 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 SERPINI1Q99574 410 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 CCDC28BQ9BUN5 200 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 AKTIPQ9H8T0 292 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 TCF7L2Q9NQB0 619 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 NMRK1Q9NWW6 199 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 VPS29Q9UBQ0 182 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 SLC12A4Q9UP95 1085 aa17.28■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 PCSK5Q92824 1860 aa17.27■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 COL12A1Q99715 3063 aa17.27■□□□□ 0.36
PTX4-201ENST00000293922 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 A0A1B0GX78 115 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 GOLGA8OA6NCC3 632 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 GOLGA8NF8WBI6 632 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 NDUFS4O43181 175 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 SEMA3DO95025 777 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 TGFB1P01137 390 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 PDGFAP04085 211 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 FOXL2P58012 376 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 GRM7Q14831 915 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 NR6A1Q15406 480 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 WASHC2DQ5SRD0 308 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 DEPDC1Q5TB30 811 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 ACAD11Q709F0 780 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 TMEM151BQ8IW70 566 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 CAMKVQ8NCB2 501 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 OR2Y1Q8NGV0 311 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 CEP70Q8NHQ1 597 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 PPP3R2Q96LZ3 170 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 SLC6A16Q9GZN6 736 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 CUTCQ9NTM9 273 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 NDOR1Q9UHB4 597 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 ANAPC2Q9UJX6 822 aa17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 MED13Q9UHV7 2174 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 LRIT2A6NDA9 550 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 DSCR3O14972 297 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 P2RX6O15547 441 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 ONECUT2O95948 504 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 SLC35G6P0C7Q6 338 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 ATP1A4Q13733 1029 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 SMU1Q2TAY7 513 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 TMEM35AQ53FP2 167 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 C6orf136Q5SQH8 315 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 OGFOD2Q6N063 350 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 ASB18Q6ZVZ8 466 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 CHSY3Q70JA7 882 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 AICDAQ9GZX7 198 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 OR51B5Q9H339 312 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 LRTM1Q9HBL6 345 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 C1orf109Q9NX04 203 aa17.26■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 PEX11AO75192 247 aa17.25■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 MED26O95402 600 aa17.25■□□□□ 0.35
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PTX4-201ENST00000293922 UMODP07911 640 aa17.25■□□□□ 0.35
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PTX4-201ENST00000293922 ARFIP1P53367 373 aa17.25■□□□□ 0.35
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PTX4-201ENST00000293922 RGS1Q08116 209 aa17.25■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 SSPNQ14714 243 aa17.25■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 KIAA0040Q15053 153 aa17.25■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 AP5B1Q2VPB7 878 aa17.25■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 PRTGQ2VWP7 1150 aa17.25■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 COX15Q7KZN9 410 aa17.25■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 MRGPREQ86SM8 312 aa17.25■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 RAB43Q86YS6 212 aa17.25■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 DTWD1Q8N5C7 304 aa17.25■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 CSNK1A1LQ8N752 337 aa17.25■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
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