RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 RNF146Q9NTX7 359 aa9.22□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 BABAM2Q9NXR7 383 aa9.22□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.22□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 MPP6Q9NZW5 540 aa9.22□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 CLEC2DQ9UHP7 191 aa9.22□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 HCN2Q9UL51 889 aa9.22□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 ERVW-1Q9UQF0 538 aa9.22□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 FOCADQ5VW36 1801 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 TRIP11Q15643 1979 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 OR4F21O95013 312 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 FABP3P05413 133 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 URODP06132 367 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 AKT1P31749 480 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 PBX3P40426 434 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 AGTR2P50052 363 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 CDKN2DP55273 166 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 VLDLRP98155 873 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 28.3
TMOD1-203ENST00000395211 CCINQ13939 588 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 RTP2Q5QGT7 225 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF549Q6P9A3 640 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 ACOT1Q86TX2 421 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 FBXO39Q8N4B4 442 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 TSPEARQ8WU66 669 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 UCN3Q969E3 161 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 SPSB2Q99619 263 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 PDCD10Q9BUL8 212 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 ABCG5Q9H222 651 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 DERAQ9Y315 318 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-203ENST00000395211 NUP205Q92621 2012 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 OR51F1A6NGY5 319 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 H0YCG3 227 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 L7N2F9 121 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 HCN1O60741 890 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ADORA2BP29275 332 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 AQP1P29972 269 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PRKAR1BP31321 381 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 MC2RQ01718 297 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 TNFRSF17Q02223 184 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 FAM180BQ6P0A1 224 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 RAB11FIP2Q7L804 512 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 TRIM69Q86WT6 500 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 C10orf111Q8N326 155 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 LIX1Q8N485 282 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 GANCQ8TET4 914 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SLC13A3Q8WWT9 602 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PFDN5Q99471 154 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 DDOQ99489 341 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SLC38A3Q99624 504 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 FSD1LQ9BXM9 530 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 EVA1AQ9H8M9 152 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 HHATLQ9HCP6 504 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 A0A1B0GV90 55 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 RRN3P2A6NIE6 340 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 OR6C65A6NJZ3 312 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 VPS4BO75351 444 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ADRA2AP08913 450 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CD63P08962 238 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 OR56A5P0C7T3 313 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 EIF1P41567 113 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 JAK3P52333 1124 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ACLYP53396 1101 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PRMT2P55345 433 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 LCP2Q13094 533 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CAMK1Q14012 370 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 OR4D1Q15615 310 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SOWAHAQ2M3V2 549 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ANKS6Q68DC2 871 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 OR5T2Q8NGG2 359 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ACER1Q8TDN7 264 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 C10orf90Q96M02 699 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 C12orf66Q96MD2 445 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 WDFY2Q96P53 400 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ZIC5Q96T25 663 aa9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.5 ms