RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 OR51Q1Q8NH59 317 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 OR2W6PQ8NHA6 318 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 ACMSDQ8TDX5 336 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 CRB3Q9BUF7 120 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 PPCSQ9HAB8 311 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 C14orf105Q9NVL8 296 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 HCN3Q9P1Z3 774 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 C3orf18Q9UK00 162 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 LRIT2A6NDA9 550 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 SMIM23A6NLE4 172 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 IDSB3KWA1 339 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 K7EM74 188 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 AGPSO00116 658 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 STX16O14662 325 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 JRKO75564 520 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 CLEC3AO75596 197 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 BMP10O95393 424 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 IGHEP01854 428 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 PYGBP11216 843 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 SFTPCP11686 197 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 GSTM2P28161 218 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 CCL11P51671 97 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 RAB8AP61006 207 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 LAPTM5Q13571 262 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 GTF2H2Q13888 395 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 EMBQ6PCB8 327 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 ABHD13Q7L211 337 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 LCA5Q86VQ0 697 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 CNPY4Q8N129 248 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 ZNF843Q8N446 348 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 CAVIN3Q969G5 261 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 SLC25A18Q9H1K4 315 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 RHBGQ9H310 441 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 ACSS2Q9NR19 701 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 TMCO1Q9UM00 188 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 URADA6NGE7 173 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 PEX12O00623 359 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 SMIM24O75264 130 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 CEACAM4O75871 244 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 NUDT17P0C025 328 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 XCR1P46094 333 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 EMP2P54851 167 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 RRADP55042 308 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 RBBP7Q16576 425 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 DCAF10Q5QP82 559 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 LAS2Q8IYD9 372 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 CCT6BQ92526 530 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 IPPKQ9H8X2 491 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 PCTPQ9UKL6 214 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 RAB21Q9UL25 225 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 OR2W5A6NFC9 320 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 A8MT66 165 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 OR7A17O14581 309 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 CHST10O43529 356 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 CDH16O75309 829 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 ALOX12BO75342 701 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 HEXBP07686 556 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 GSTA1P08263 222 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 NR1D1P20393 614 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 OLR1P78380 273 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 LIPJQ5W064 366 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 MED27Q6P2C8 311 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 OR7G3Q8NG95 312 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 C8orf44Q96CB5 159 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 PEX11GQ96HA9 241 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms