RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A6NJY4 79 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FOXK2Q01167 660 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM26DQ5JW98 314 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NGLY1Q96IV0 654 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POLIQ9UNA4 740 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FSHRP23945 695 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATP2B1P20020 1258 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNNI2P48788 182 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMTNP53814 917 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EDEM1Q92611 657 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LNPKQ9C0E8 428 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GNRH1P01148 92 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SKOR1P84550 965 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM32Q13049 653 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM52Q96A61 297 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYO19Q96H55 970 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP3Q9Y6I4 520 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GNA15P30679 374 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYT1Q01538 1121 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MTFR1Q15390 333 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GJD3Q8N144 294 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LILRA1O75019 489 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDGFAP04085 211 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTPN5P54829 565 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TLR1Q15399 786 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKRD62A6NC57 917 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRM5P41594 1212 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZAP70P43403 619 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP5P45974 858 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WNT7BP56706 349 aa7.31□□□□□ -1.24
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 DGKZQ13574 1117 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CSRNP1Q96S65 589 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SERTM1A2A2V5 107 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDK2AP1O14519 115 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL2RAP01589 272 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTSHP09668 335 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF394Q53GI3 561 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDK15Q96Q40 435 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KLK14Q9P0G3 267 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AK5Q9Y6K8 562 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EML1O00423 815 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC144BQ3MJ40 725 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBF1Q8TES7 1133 aa7.29□□□□□ -1.24
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