RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 SERTM1A2A2V5 107 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 AVPP01185 164 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 NOS2P35228 1153 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 MTMR3Q13615 1198 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 C16orf46Q6P387 395 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 GLYCTKQ8IVS8 523 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 RHBDD1Q8TEB9 315 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 GRIP2Q9C0E4 1043 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 CABP1Q9NZU7 370 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 FAM187AA6NFU0 413 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 UPP2O95045 317 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 ECM1Q16610 540 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 SLC27A3Q5K4L6 730 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 COX20Q5RI15 118 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 Q6ZNB5 142 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 L3MBTL2Q969R5 705 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 MYO19Q96H55 970 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 SAP130Q9H0E3 1048 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 NPR3P17342 541 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGAP4P98171 946 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 GNASQ5JWF2 1037 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 LRFN2Q9ULH4 789 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 PARP3Q9Y6F1 533 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 LCE2BO14633 110 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 TNFRSF10BO14763 440 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 FAM13AO94988 1023 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 BMP2P12643 396 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 MPSTP25325 297 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 MARSP56192 900 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 CTC1Q2NKJ3 1217 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 C4orf17Q53FE4 359 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 C6orf118Q5T5N4 469 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 RNF217Q8TC41 542 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 NGLY1Q96IV0 654 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 DGAT1O75907 488 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 BMP1P13497 986 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 PLA2G4AP47712 749 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 RTN1Q16799 776 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 C1orf53Q5VUE5 145 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM46Q7Z4K8 759 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 PHACTR1Q9C0D0 580 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 STIM2Q9P246 746 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 ERCC3P19447 782 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 TXLNAP40222 546 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 SCARF1Q14162 830 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 PKDCCQ504Y2 493 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 CRIPAKQ8N1N5 446 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 TTLL8A6PVC2 850 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 BRD2P25440 801 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 POU4F2Q12837 409 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 DGKZQ13574 1117 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 NBPF1Q3BBV0 1214 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 WDR44Q5JSH3 913 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 FAM26DQ5JW98 314 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 ABTB2Q8N961 1025 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-205ENST00000391970 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
PTPRC-205ENST00000391970 AXIN1O15169 862 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-205ENST00000391970 MAPK1P28482 360 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-205ENST00000391970 PHKA2P46019 1235 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-205ENST00000391970 LAPTM4AQ15012 233 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-205ENST00000391970 ALKBH2Q6NS38 261 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-205ENST00000391970 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-205ENST00000391970 C7orf43Q8WVR3 580 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-205ENST00000391970 ASB16Q96NS5 453 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-205ENST00000391970 KLK14Q9P0G3 267 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB39O15060 712 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-205ENST00000391970 FZD6O60353 706 aa5.38□□□□□ -1.55
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