RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC186Q7Z3E2 898 aa27.08■■□□□ 1.93
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP7BP35670 1465 aa27.07■■□□□ 1.92
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AOX1Q06278 1338 aa27.06■■□□□ 1.92
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.06■■□□□ 1.92
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.06■■□□□ 1.92
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC4A2P04920 1241 aa27.06■■□□□ 1.92
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRVI1Q9Y6F6 885 aa27.04■■□□□ 1.92
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTMR6Q9Y217 621 aa27.03■■□□□ 1.92
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAD50Q92878 1312 aa27.03■■□□□ 1.92
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.02■■□□□ 1.92
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IL25Q9H293 177 aa27.02■■□□□ 1.92
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DRC7Q8IY82 874 aa27.02■■□□□ 1.92
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POGZQ7Z3K3 1410 aa27■■□□□ 1.91
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUP62CLQ9H1M0 184 aa27■■□□□ 1.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PREX1Q8TCU6 1659 aa27■■□□□ 1.91
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KMT5BQ4FZB7 885 aa27■■□□□ 1.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GJB2P29033 226 aa26.99■■□□□ 1.91
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLFNL1Q499Z3 407 aa26.98■■□□□ 1.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CBX8Q9HC52 389 aa26.98■■□□□ 1.91
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CEP135Q66GS9 1140 aa26.98■■□□□ 1.91
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VGLL3A8MV65 326 aa26.97■■□□□ 1.91
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.96■■□□□ 1.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IDI1Q13907 227 aa26.96■■□□□ 1.91
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 G2E3Q7L622 706 aa26.96■■□□□ 1.91
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC171Q6TFL3 1326 aa26.96■■□□□ 1.91
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDC25BP30305 580 aa26.94■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HYPKQ9NX55 129 aa26.94■■□□□ 1.9
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRT85P78386 507 aa26.93■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LARGE1O95461 756 aa26.93■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TTC6Q86TZ1 520 aa26.93■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERO1AQ96HE7 468 aa26.93■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TNMDQ9H2S6 317 aa26.93■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARHGEF10O15013 1369 aa26.93■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LIG1P18858 919 aa26.92■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CAMK4Q16566 473 aa26.92■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NYAP1Q6ZVC0 841 aa26.92■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.92■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.91■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa26.91■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.91■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.91■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CASTP20810 708 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
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