RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479153.1

SUMO3-206, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 1,736 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-206	ENST00000479153	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	KLF11	O14901	512 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF749	O43361	778 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	SCRG1	O75711	98 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	MED26	O95402	600 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	B3GALT4	O96024	378 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	KRT6A	P02538	564 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	KRT6B	P04259	564 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	NTRK1	P04629	796 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	UROS	P10746	265 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	FGF5	P12034	268 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	KRT6C	P48668	564 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	OCRL	Q01968	901 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	HYAL2	Q12891	473 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	IL11RA	Q14626	422 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	TCTE1	Q5JU00	501 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	TTL	Q8NG68	377 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	TAAR9	Q96RI9	348 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	AICDA	Q9GZX7	198 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	OR51B5	Q9H339	312 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153		A0A0G2JN53	185 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	C9orf172	C9J069	976 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	ULK1	O75385	1050 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	CLEC3A	O75596	197 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	ETHE1	O95571	254 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF28	P17035	718 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	RGS1	Q08116	209 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	CAMK2B	Q13554	666 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	KANK2	Q63ZY3	851 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	F2RL3	Q96RI0	385 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	MS4A8	Q9BY19	250 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	NLN	Q9BYT8	704 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	HYKK	A2RU49	373 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	C4orf51	C9J302	202 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	KIAA0754	O94854	1291 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	SERPINA6	P08185	405 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	FGF4	P08620	206 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	ALAS2	P22557	587 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	PIK3CB	P42338	1070 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	RAB15	P59190	212 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	RAB8A	P61006	207 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	PHEX	P78562	749 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	HMGCS1	Q01581	520 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	PWP1	Q13610	501 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	GRM7	Q14831	915 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	C1orf189	Q5VU69	101 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	NT5C	Q8TCD5	201 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	C10orf90	Q96M02	699 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	WASF3	Q9UPY6	502 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	AK5	Q9Y6K8	562 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	FITM1	A5D6W6	292 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	LRIT2	A6NDA9	550 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	TXNDC9	O14530	226 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	LINC00032	P0C843	101 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	IL1RN	P18510	177 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SUMO3-206	ENST00000479153	PLA2G16	P53816	162 aa		12.48	□□□□□ -0.41

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