RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 XPR1Q9UBH6 696 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 OPTCQ9UBM4 332 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 TBK1Q9UHD2 729 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 ATRXP46100 2492 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 H0YIG0 161 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SGK494L7N484 410 aa14.9□□□□□ -0.02
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ACTB-206ENST00000443528 WFS1O76024 890 aa14.9□□□□□ -0.02
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ACTB-206ENST00000443528 HSD17B3P37058 310 aa14.9□□□□□ -0.02
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ACTB-206ENST00000443528 AVPR1BP47901 424 aa14.9□□□□□ -0.02
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ACTB-206ENST00000443528 PCDH1Q08174 1060 aa14.9□□□□□ -0.02
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ACTB-206ENST00000443528 CHIT1Q13231 466 aa14.9□□□□□ -0.02
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ACTB-206ENST00000443528 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.021e-7■■■■□ 20.3
ACTB-206ENST00000443528 XKR6Q5GH73 641 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 KRT78Q8N1N4 520 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 TEX9Q8N6V9 391 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 MIEF2Q96C03 454 aa14.9□□□□□ -0.02
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ACTB-206ENST00000443528 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.9□□□□□ -0.02
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ACTB-206ENST00000443528 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 ING2Q9H160 280 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 ADNPQ9H2P0 1102 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 KLHL31Q9H511 634 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 TUBD1Q9UJT1 453 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 A0A1W2PPM1 405 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 C4orf51C9J302 202 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 SOCS6O14544 535 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 KLHL18O94889 574 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 B3GALT4O96024 378 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 SERPINA6P08185 405 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 EPB42P16452 691 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 ALOX12P18054 663 aa14.89□□□□□ -0.03
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ACTB-206ENST00000443528 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 CYP4X1Q8N118 509 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 NACC2Q96BF6 587 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 PHF21BQ96EK2 531 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 SMIM10Q96HG1 83 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 IP6K3Q96PC2 410 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 MESP1Q9BRJ9 268 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.89□□□□□ -0.03
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ACTB-206ENST00000443528 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.89□□□□□ -0.03
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ACTB-206ENST00000443528 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa14.89□□□□□ -0.03
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ACTB-206ENST00000443528 ZNF860A6NHJ4 632 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 GOLGA8RI6L899 631 aa14.88□□□□□ -0.03
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ACTB-206ENST00000443528 HERC3Q15034 1050 aa14.88□□□□□ -0.03
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ACTB-206ENST00000443528 DEFB134Q4QY38 66 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 SH2D5Q6ZV89 423 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 MED25Q71SY5 747 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 TTLQ8NG68 377 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.88□□□□□ -0.03
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