RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 CRELD1Q96HD1 420 aa16.56■□□□□ 0.24
TRPC1-201ENST00000273482 BBS4Q96RK4 519 aa16.56■□□□□ 0.24
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TRPC1-201ENST00000273482 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TRPC1-201ENST00000273482 NRXN2Q9P2S2 1712 aa16.56■□□□□ 0.24
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TRPC1-201ENST00000273482 SNAPC1Q16533 368 aa16.56■□□□□ 0.24
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TRPC1-201ENST00000273482 C11orf88Q6PI97 169 aa16.56■□□□□ 0.24
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TRPC1-201ENST00000273482 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.56■□□□□ 0.24
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TRPC1-201ENST00000273482 ZNF614Q8N883 585 aa16.56■□□□□ 0.24
TRPC1-201ENST00000273482 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF675Q8TD23 568 aa16.56■□□□□ 0.24
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa16.56■□□□□ 0.24
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TRPC1-201ENST00000273482 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
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TRPC1-201ENST00000273482 CD247P20963 164 aa16.54■□□□□ 0.24
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TRPC1-201ENST00000273482 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TRPC1-201ENST00000273482 BTN2A2Q8WVV5 523 aa16.54■□□□□ 0.24
TRPC1-201ENST00000273482 KCNJ9Q92806 393 aa16.54■□□□□ 0.24
TRPC1-201ENST00000273482 B4GALT6Q9UBX8 382 aa16.54■□□□□ 0.24
TRPC1-201ENST00000273482 AASSQ9UDR5 926 aa16.54■□□□□ 0.24
TRPC1-201ENST00000273482 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TRPC1-201ENST00000273482 POFUT2Q9Y2G5 429 aa16.54■□□□□ 0.24
TRPC1-201ENST00000273482 GPR45Q9Y5Y3 372 aa16.54■□□□□ 0.24
TRPC1-201ENST00000273482 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
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