RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 NEFHP12036 1026 aa17.55■□□□□ 0.4
PTX4-201ENST00000293922 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
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PTX4-201ENST00000293922 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
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PTX4-201ENST00000293922 MAGEB18Q96M61 343 aa17.55■□□□□ 0.4
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PTX4-201ENST00000293922 PTCHD3Q3KNS1 767 aa17.54■□□□□ 0.4
PTX4-201ENST00000293922 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP17.54■□□□□ 0.4
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF843Q8N446 348 aa17.54■□□□□ 0.4
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PTX4-201ENST00000293922 CCNYL1Q8N7R7 359 aa17.53■□□□□ 0.4
PTX4-201ENST00000293922 LINC01555Q8NAE3 123 aa17.53■□□□□ 0.4
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PTX4-201ENST00000293922 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
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PTX4-201ENST00000293922 OPTCQ9UBM4 332 aa17.53■□□□□ 0.4
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PTX4-201ENST00000293922 TMEM114B3SHH9 223 aa17.52■□□□□ 0.4
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PTX4-201ENST00000293922 STX3Q13277 289 aa17.52■□□□□ 0.4
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PTX4-201ENST00000293922 CYB5D1Q6P9G0 228 aa17.52■□□□□ 0.4
PTX4-201ENST00000293922 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
PTX4-201ENST00000293922 FRMD7Q6ZUT3 714 aa17.52■□□□□ 0.4
PTX4-201ENST00000293922 EXD3Q8N9H8 876 aa17.52■□□□□ 0.4
PTX4-201ENST00000293922 GALNT6Q8NCL4 622 aa17.52■□□□□ 0.4
PTX4-201ENST00000293922 PPFIBP2Q8ND30 876 aa17.52■□□□□ 0.4
PTX4-201ENST00000293922 LRRC8CQ8TDW0 803 aa17.52■□□□□ 0.4
PTX4-201ENST00000293922 SMPDL3AQ92484 453 aa17.52■□□□□ 0.4
PTX4-201ENST00000293922 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
PTX4-201ENST00000293922 PYCR2Q96C36 320 aa17.52■□□□□ 0.4
PTX4-201ENST00000293922 MOCOSQ96EN8 888 aa17.52■□□□□ 0.4
PTX4-201ENST00000293922 CNDP1Q96KN2 507 aa17.52■□□□□ 0.4
PTX4-201ENST00000293922 TRMOQ9BU70 441 aa17.52■□□□□ 0.4
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