RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM198Q66K66 360 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC01551Q86U37 167 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPAT4Q86UL3 456 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 RASGEF1CQ8N431 466 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR5T2Q8NGG2 359 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC22A8Q8TCC7 542 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDXPQ96GD0 296 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC35E1Q96K37 410 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRGUKQ96M69 825 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOPNLQ96NB1 174 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNTG1Q9NSN8 517 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 CEPT1Q9Y6K0 416 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 DGKBQ9Y6T7 804 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 POM121BA6NF01 834 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 GLTPD2A6NH11 291 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 A8MU76 341 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLIM4O00461 696 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIP5K1BO14986 540 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGKV1-16P04430 117 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 SERPINA4P29622 427 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRPC1P48995 793 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPM6AP51674 278 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 RIDAP52758 137 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 HERVK_113P61574 105 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 VLDLRP98155 873 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL9RQ01113 521 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 HERC3Q15034 1050 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 EXT1Q16394 746 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 TXNDC8Q6A555 127 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 HCP5Q6MZN7 132 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM156AQ8NDB6 213 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR52N5Q8NH56 324 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPATA17Q96L03 361 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 EYA3Q99504 573 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 NMUR2Q9GZQ4 415 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBP1Q9H171 429 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLA2Q9H6Q3 261 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 NANOGQ9H9S0 305 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 SGK2Q9HBY8 427 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 FGF21Q9NSA1 209 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 IP6K2Q9UHH9 426 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRLS1Q9UJA2 301 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCND3Q9UK17 655 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 EID1Q9Y6B2 187 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 TEX28O15482 410 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADAM12O43184 909 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASNA1O43681 348 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRT33AO76009 404 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 TFP02787 698 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 EEF2P13639 858 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 UGT1A6P19224 532 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSPA4P34932 840 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR3A2P47893 321 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 LBX1P52954 281 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 HMGCS2P54868 508 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRKCEQ02156 737 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM132DQ14C87 1099 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC35G1Q2M3R5 365 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAF7LQ5H9L4 462 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 LIN54Q6MZP7 749 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 RFWD3Q6PCD5 774 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNTROBQ8N137 903 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 EMC1Q8N766 993 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR13F1Q8NGS4 319 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNE4Q8WWG9 221 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 JAKMIP2Q96AA8 810 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00477Q96M19 166 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYD88Q99836 296 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 VN1R1Q9GZP7 353 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMLHEQ9NVH6 421 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 BAG5Q9UL15 447 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 CORO2BQ9UQ03 480 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 F8VVB4 439 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 F8VWA3 439 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 SAP18O00422 153 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHG1P01857 330 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANGP03950 147 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
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