RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516658.1

RNU6-347P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 347, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-347P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-347P-201ENST00000516658 CARFQ8N187 725 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 BCORP1Q8N888 145 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 EXD3Q8N9H8 876 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 OR4A16Q8NH70 328 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF671Q8TAW3 534 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 GGHQ92820 318 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 APBB2Q92870 758 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 SNAPC3Q92966 411 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 PEX13Q92968 403 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 LRRC39Q96DD0 335 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 C16orf58Q96GQ5 468 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 SIGLEC10Q96LC7 697 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 BCL7BQ9BQE9 202 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 CDK19Q9BWU1 502 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 HAUS4Q9H6D7 363 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 ACTR8Q9H981 624 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 HHATLQ9HCP6 504 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 MYNNQ9NPC7 610 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 LZTFL1Q9NQ48 299 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 CYSLTR2Q9NS75 346 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 AP4B1Q9Y6B7 739 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMEM94Q12767 1356 aa4.53□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 TNIKQ9UKE5 1360 aa4.53□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 ABCC4O15439 1325 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 A0A087X0K7 114 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 LOC100653049A0A140TA62 436 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 NEMP2A6NFY4 417 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF716A6NP11 495 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 BTBD19C9JJ37 291 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 J3QR06 171 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 LGALS8O00214 317 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 CHEK1O14757 476 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF208O43345 1280 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 GRID2O43424 1007 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 PLPP2O43688 288 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 CSO75390 466 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 KRT34O76011 436 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 NDUFA10O95299 355 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 WNT11O96014 354 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 EGFP01133 1207 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 GSTA2P09210 222 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF735P0CB33 412 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 FPR3P25089 353 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 TACR3P29371 465 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 PRDX6P30041 224 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 BMI1P35226 326 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 MMP15P51511 669 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 NUDT6P53370 316 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 GSDMDP57764 484 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 PPP2CBP62714 309 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 PPP2CAP67775 309 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 CBX1P83916 185 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 IL10RBQ08334 325 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPOCK1Q08629 439 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 UBE2V1Q13404 147 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 RBBP7Q16576 425 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 PRSS36Q5K4E3 855 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 CARD17Q5XLA6 110 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 SEL1L3Q68CR1 1132 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 LRRC55Q6ZSA7 311 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 SLC16A9Q7RTY1 509 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAM131BQ86XD5 332 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 LAX1Q8IWV1 398 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 ARHGAP24Q8N264 748 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 DCLK2Q8N568 766 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF321PQ8N8H1 164 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 TERB1Q8NA31 727 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 OR2T3Q8NH03 318 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 STARD8Q92502 1023 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 C19orf60Q96EN9 201 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 TUBA1CQ9BQE3 449 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 SGPP1Q9BX95 441 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 FSD1LQ9BXM9 530 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 RIOX1Q9H6W3 641 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-347P-201ENST00000516658 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms