RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CIDEBQ9UHD4 219 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FER1L5A0AVI2 2057 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGP20916 626 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AOAHP28039 575 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MENTQ9BUN1 341 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EURLQ9NYK6 297 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL20Q9Y2M5 609 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCSK5Q92824 1860 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLCO2B1O94956 709 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRADDP78560 199 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRB7Q14451 532 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC9A5Q14940 896 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C4orf22Q6V702 233 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2Y1Q8NGV0 311 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2L8Q8NGY9 312 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSDMBQ8TAX9 411 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL17FQ96PD4 163 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFRPQ9BY79 579 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC39A10Q9ULF5 831 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AP3B1O00203 1094 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PEX12O00623 359 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 S1PR4O95977 384 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UQCRFS1P47985 274 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BASP1P80723 227 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAPSNQ13702 412 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC23LQ6PF05 361 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSTA5Q7RTV2 222 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAX1BP1Q86VP1 789 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLG3Q92796 817 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PANX3Q96QZ0 392 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL22Q9GZX6 179 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLAMF7Q9NQ25 335 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TREX1Q9NSU2 369 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNPTGQ9UJJ9 305 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASGRF2O14827 1237 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFS3O75489 264 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHEP01854 428 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNLYP22749 145 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPY2RP49146 381 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC6Q86X45 466 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPP5Q8N3R9 675 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC1AQ8NC01 280 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTERQ96BW5 349 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 P2RY12Q9H244 342 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BFARQ9NZS9 450 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LUZP4Q9P127 313 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KPNA5O15131 536 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GP1BBP13224 206 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALAS2P22557 587 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NMBRP28336 390 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARSFP54793 590 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SF1Q15637 639 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC6A19Q695T7 634 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAIP1Q8WWC4 291 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C5AR2Q9P296 337 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCAF10Q5QP82 559 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FIGLAQ6QHK4 219 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTLL10Q6ZVT0 673 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OTOAQ7RTW8 1153 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OTUD6BQ8N6M0 293 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q8NA96 180 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DENND1AQ8TEH3 1009 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNPLA2Q96AD5 504 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAD51AP1Q96B01 352 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LZTFL1Q9NQ48 299 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 P4HTMQ9NXG6 502 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRFAP1Q9Y605 127 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC88CQ9P219 2028 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGGP02679 453 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
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