RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 MLNP12872 115 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 IL2RBP14784 551 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 JUPP14923 745 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 NPR1P16066 1061 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ARHGDIBP52566 201 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 TAS2R39P59534 338 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 POU4F1Q01851 419 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ANGPT1Q15389 498 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 TRIQKQ629K1 86 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 QRFPRQ96P65 431 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ASB7Q9H672 318 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ACAD9Q9H845 621 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 TAS2R7Q9NYW3 318 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 FZD9O00144 591 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 BTN3A1O00481 513 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 SULT1B1O43704 296 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 VIPP01282 170 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 RAF1P04049 648 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ALPPP05187 535 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ACSM4P0C7M7 580 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 PCSK2P16519 638 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 GNPDA1P46926 289 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 HERVK_113P63132 956 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 TCP10Q12799 353 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF79Q15937 498 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 TSTQ16762 297 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 IER5Q5VY09 327 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 TRNP1Q6NT89 227 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 KDELC2Q7Z4H8 507 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 WDR48Q8TAF3 677 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 DNASE1L2Q92874 299 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 PTP4A1Q93096 173 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 P2RY11Q96G91 374 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 TAF1P21675 1872 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 A0A087WZ62 844 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 TTLL8A6PVC2 850 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 SGCEO43556 437 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 TOXO94900 526 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 KDM4BO94953 1096 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 GDF11O95390 407 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 APOC1P02654 83 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 STSP08842 583 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 LBPP18428 481 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 FOXA1P55317 472 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 CREMQ03060 361 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 PLD1Q13393 1074 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF699Q32M78 642 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 HSD17B12Q53GQ0 312 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 MFSD14BQ5SR56 506 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 MPP7Q5T2T1 576 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 SMIM5Q71RC9 77 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 FAM160B2Q86V87 743 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 RDH10Q8IZV5 341 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 SLC34A3Q8N130 599 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 OR5K1Q8NHB7 308 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 TWIST2Q8WVJ9 160 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 REPS1Q96D71 796 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 MYO19Q96H55 970 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 GPR22Q99680 433 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 NPAS1Q99742 590 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 LRRC3Q9BY71 257 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 MUC13Q9H3R2 512 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 RHOJQ9H4E5 214 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ALG9Q9H6U8 611 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 SLC39A1Q9NY26 324 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 ANKRD28O15084 1053 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD1-203ENST00000395211 PRAMEF10O60809 474 aa9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms