RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BTBD6Q96KE9 485 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C2CD2LO14523 706 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VSIG10Q8N0Z9 540 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GGA1Q9UJY5 639 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BTBD11A6QL63 1104 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EPXP11678 715 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BMP4P12644 408 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A1B0GTH6 734 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GATA4P43694 442 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPAMQ9HCL2 828 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRAK2O60296 914 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARAFP10398 606 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARTNQ5T4W7 220 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FGFR3P22607 806 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RNF135Q8IUD6 432 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AP1G2O75843 785 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CTBSQ01459 385 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SCTRP47872 440 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RNF20Q5VTR2 975 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHSY3Q70JA7 882 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BNIP3LO60238 219 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CENPCQ03188 943 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EFHC2Q5JST6 749 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PGBD3Q8N328 593 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RUBCNLQ9H714 662 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GNRH1P01148 92 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 USP17L8P0C7I0 530 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PHKA2P46019 1235 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CNKSR1Q969H4 720 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZBBXA8MT70 800 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IL2RAP01589 272 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MSX1P28360 303 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM11Q96F44 468 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DYRK3O43781 588 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C4orf17Q53FE4 359 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GNASQ5JWF2 1037 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NBPF11Q86T75 865 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 XAGE2Q96GT9 111 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLVAPQ9BX97 442 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FBXO45P0C2W1 286 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADH6P28332 368 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KLF15Q9UIH9 416 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM182BQ5T319 152 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF592Q92610 1267 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRP8Q14114 963 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NLRP8Q86W28 1048 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HCN2Q9UL51 889 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 APBA3O96018 575 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RFC5P40937 340 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms