RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 STK17AQ9UEE5 414 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 USP17L3A6NCW0 530 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 USP17L4A6NCW7 530 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 VSIG8P0DPA2 414 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCNN1DP51172 638 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 SV2AQ7L0J3 742 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM50Q86XT4 487 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDR44Q5JSH3 913 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.4□□□□□ -1.38
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RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP1A2P50993 1020 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMTNP53814 917 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 H7C1W4 665 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 F11P03951 625 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 C4orf17Q53FE4 359 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZMYND15Q9H091 742 aa6.39□□□□□ -1.39
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RNU6-38P-201ENST00000384085 DBN1Q16643 649 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 OGFOD1Q8N543 542 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 AIDAQ96BJ3 306 aa6.38□□□□□ -1.39
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RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPAMQ9HCL2 828 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF358Q9NW07 568 aa6.38□□□□□ -1.39
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RNU6-38P-201ENST00000384085 RUBCNLQ9H714 662 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.34□□□□□ -1.39
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RNU6-38P-201ENST00000384085 SFI1A8K8P3 1242 aa6.33□□□□□ -1.4
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RNU6-38P-201ENST00000384085 TBCELQ5QJ74 424 aa6.33□□□□□ -1.4
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RNU6-38P-201ENST00000384085 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDCA8Q53HL2 280 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 EFHC2Q5JST6 749 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEC13P55735 322 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 SIX5Q8N196 739 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
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