RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364281.1

SNORD56.5-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 72 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.5-201ENST00000364281 LRRC27Q9C0I9 530 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 NBPF3Q9H094 633 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 CCSER2Q9H7U1 834 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 FAM13BQ9NYF5 915 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 POLG2Q9UHN1 485 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 A0A1W2PRQ8 180 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 CHL1O00533 1208 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 TBX3O15119 743 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 NPHP1O15259 732 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 KCNA2P16389 499 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 NOS2P35228 1153 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 USP5P45974 858 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 TRAPPC10P48553 1259 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 TERF1P54274 439 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 AMPD3Q01432 767 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 WASHC5Q12768 1159 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 NEUROD1Q13562 356 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 SLF2Q8IX21 1173 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 KIAA1958Q8N8K9 716 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 ERP27Q96DN0 273 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 CDHR1Q96JP9 859 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 ARPC5LQ9BPX5 153 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 TSPY26PQ9H489 355 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 LGR6Q9HBX8 967 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 CAPN10Q9HC96 672 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 PGAP2Q9UHJ9 254 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 CHMP3Q9Y3E7 222 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 EID1Q9Y6B2 187 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 GNPATO15228 680 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 KRT18P05783 430 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 MYL1P05976 194 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 RBP3P10745 1247 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 RPL17P18621 184 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 PSMA3P25788 255 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 ITGAEP38570 1179 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 ZNF132P52740 706 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 NUBP1P53384 320 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 PPP2R5AQ15172 486 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 WASHC4Q2M389 1173 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 RGL3Q3MIN7 710 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 CCDC93Q567U6 631 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 PPP2R2DQ66LE6 453 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 CCDC70Q6NSX1 233 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 PPP1R18Q6NYC8 613 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 PDXDC1Q6P996 788 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 ASB16Q96NS5 453 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 ARNT2Q9HBZ2 717 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 PHF8Q9UPP1 1060 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 TNFRSF10BO14763 440 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 NR1I2O75469 434 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 TCEA3O75764 348 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 IGHDP01880 384 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 MYL3P08590 195 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 PIK3CAP42336 1068 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 TRPC1P48995 793 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 CLK2P49760 499 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 RGS3P49796 1198 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 FAM160A1Q05DH4 1040 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 IFT88Q13099 833 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 TMED1Q13445 227 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 HIC1Q14526 733 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 TAF11Q15544 211 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 LONRF1Q17RB8 773 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 LDLRAD1Q5T700 205 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 C9orf131Q5VYM1 1079 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD56.5-201ENST00000364281 NFXL1Q6ZNB6 911 aa3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms