Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ssxb10Q6XAR7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ssxb10Q6XAR7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ssxb10Q6XAR7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssxb10Q6XAR7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ssxb10Q6XAR7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Ssxb10Q6XAR7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Ssxb10Q6XAR7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ssxb10Q6XAR7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ssxb10Q6XAR7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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