Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme1P97371 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme1P97371 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme1P97371 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme1P97371 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms