Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms