Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
1700019A02RikA0A087WPV9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700019A02RikA0A087WPV9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms