Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
IMPG1Q17R60 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
IMPG1Q17R60 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
IMPG1Q17R60 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.29
IMPG1Q17R60 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
IMPG1Q17R60 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
IMPG1Q17R60 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
IMPG1Q17R60 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
IMPG1Q17R60 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-5.65□□□□□ -3.31
IMPG1Q17R60 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-5.69□□□□□ -3.32
IMPG1Q17R60 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-5.73□□□□□ -3.33
IMPG1Q17R60 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-5.73□□□□□ -3.33
IMPG1Q17R60 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-5.78□□□□□ -3.33
IMPG1Q17R60 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-5.79□□□□□ -3.34
IMPG1Q17R60 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
IMPG1Q17R60 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
IMPG1Q17R60 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-6.03□□□□□ -3.37
IMPG1Q17R60 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-6.04□□□□□ -3.38
IMPG1Q17R60 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-6.41□□□□□ -3.44
IMPG1Q17R60 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-6.45□□□□□ -3.44
IMPG1Q17R60 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-6.46□□□□□ -3.44
IMPG1Q17R60 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-6.52□□□□□ -3.45
IMPG1Q17R60 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-6.86□□□□□ -3.51
IMPG1Q17R60 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-7.05□□□□□ -3.54
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.1 ms