Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
MEIS3Q99687 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
MEIS3Q99687 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
MEIS3Q99687 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
MEIS3Q99687 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
MEIS3Q99687 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
MEIS3Q99687 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
MEIS3Q99687 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
MEIS3Q99687 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
MEIS3Q99687 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
MEIS3Q99687 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
MEIS3Q99687 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
MEIS3Q99687 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
MEIS3Q99687 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MEIS3Q99687 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MEIS3Q99687 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MEIS3Q99687 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MEIS3Q99687 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MEIS3Q99687 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MEIS3Q99687 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MEIS3Q99687 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MEIS3Q99687 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MEIS3Q99687 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MEIS3Q99687 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MEIS3Q99687 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
MEIS3Q99687 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
MEIS3Q99687 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MEIS3Q99687 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MEIS3Q99687 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
MEIS3Q99687 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
MEIS3Q99687 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
MEIS3Q99687 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
MEIS3Q99687 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
MEIS3Q99687 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MEIS3Q99687 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MEIS3Q99687 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MEIS3Q99687 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MEIS3Q99687 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
MEIS3Q99687 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
MEIS3Q99687 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
MEIS3Q99687 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.39□□□□□ -2.63
MEIS3Q99687 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
MEIS3Q99687 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
MEIS3Q99687 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
MEIS3Q99687 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
MEIS3Q99687 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
MEIS3Q99687 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
MEIS3Q99687 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
MEIS3Q99687 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
MEIS3Q99687 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
MEIS3Q99687 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
MEIS3Q99687 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
MEIS3Q99687 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
MEIS3Q99687 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
MEIS3Q99687 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
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MEIS3Q99687 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
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MEIS3Q99687 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
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MEIS3Q99687 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
MEIS3Q99687 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
MEIS3Q99687 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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MEIS3Q99687 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
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MEIS3Q99687 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
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MEIS3Q99687 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
MEIS3Q99687 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
MEIS3Q99687 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
MEIS3Q99687 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
MEIS3Q99687 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
MEIS3Q99687 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
MEIS3Q99687 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
MEIS3Q99687 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
MEIS3Q99687 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
MEIS3Q99687 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
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