Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
MDC1Q14676 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
MDC1Q14676 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
MDC1Q14676 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
MDC1Q14676 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
MDC1Q14676 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
MDC1Q14676 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
MDC1Q14676 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
MDC1Q14676 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
MDC1Q14676 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
MDC1Q14676 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
MDC1Q14676 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
MDC1Q14676 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
MDC1Q14676 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
MDC1Q14676 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
MDC1Q14676 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.07□□□□□ -2.74
MDC1Q14676 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
MDC1Q14676 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
MDC1Q14676 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
MDC1Q14676 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
MDC1Q14676 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
MDC1Q14676 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
MDC1Q14676 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
MDC1Q14676 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
MDC1Q14676 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
MDC1Q14676 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
MDC1Q14676 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
MDC1Q14676 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
MDC1Q14676 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
MDC1Q14676 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
MDC1Q14676 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
MDC1Q14676 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
MDC1Q14676 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
MDC1Q14676 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
MDC1Q14676 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
MDC1Q14676 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
MDC1Q14676 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
MDC1Q14676 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
MDC1Q14676 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
MDC1Q14676 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
MDC1Q14676 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
MDC1Q14676 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
MDC1Q14676 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
MDC1Q14676 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
MDC1Q14676 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
MDC1Q14676 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
MDC1Q14676 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
MDC1Q14676 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
MDC1Q14676 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
MDC1Q14676 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
MDC1Q14676 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
MDC1Q14676 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
MDC1Q14676 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
MDC1Q14676 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
MDC1Q14676 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
MDC1Q14676 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
MDC1Q14676 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
MDC1Q14676 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
MDC1Q14676 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
MDC1Q14676 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
MDC1Q14676 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
MDC1Q14676 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
MDC1Q14676 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
MDC1Q14676 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
MDC1Q14676 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
MDC1Q14676 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
MDC1Q14676 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
MDC1Q14676 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
MDC1Q14676 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
MDC1Q14676 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
MDC1Q14676 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
MDC1Q14676 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
MDC1Q14676 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
MDC1Q14676 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.57□□□□□ -2.82
MDC1Q14676 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
MDC1Q14676 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
MDC1Q14676 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
MDC1Q14676 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
MDC1Q14676 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
MDC1Q14676 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
MDC1Q14676 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
MDC1Q14676 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.8 ms