Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
COL9A3Q14050 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
COL9A3Q14050 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
COL9A3Q14050 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
COL9A3Q14050 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
COL9A3Q14050 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
COL9A3Q14050 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
COL9A3Q14050 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
COL9A3Q14050 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
COL9A3Q14050 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
COL9A3Q14050 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
COL9A3Q14050 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
COL9A3Q14050 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
COL9A3Q14050 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
COL9A3Q14050 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
COL9A3Q14050 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
COL9A3Q14050 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A3Q14050 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
COL9A3Q14050 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL9A3Q14050 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
COL9A3Q14050 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.01□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COL9A3Q14050 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL9A3Q14050 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COL9A3Q14050 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
COL9A3Q14050 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
COL9A3Q14050 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
COL9A3Q14050 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL9A3Q14050 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
COL9A3Q14050 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
COL9A3Q14050 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
COL9A3Q14050 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
COL9A3Q14050 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
COL9A3Q14050 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
COL9A3Q14050 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
COL9A3Q14050 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
COL9A3Q14050 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
COL9A3Q14050 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
COL9A3Q14050 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
COL9A3Q14050 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
COL9A3Q14050 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
COL9A3Q14050 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
COL9A3Q14050 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
COL9A3Q14050 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
COL9A3Q14050 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
COL9A3Q14050 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
COL9A3Q14050 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
COL9A3Q14050 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
COL9A3Q14050 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
COL9A3Q14050 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
COL9A3Q14050 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
COL9A3Q14050 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
COL9A3Q14050 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
COL9A3Q14050 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
COL9A3Q14050 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
COL9A3Q14050 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
COL9A3Q14050 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
COL9A3Q14050 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
COL9A3Q14050 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
COL9A3Q14050 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
COL9A3Q14050 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
COL9A3Q14050 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
COL9A3Q14050 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
COL9A3Q14050 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
COL9A3Q14050 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
COL9A3Q14050 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263 ms