Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TMPOP42166 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TMPOP42166 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TMPOP42166 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TMPOP42166 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TMPOP42166 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TMPOP42166 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TMPOP42166 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TMPOP42166 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TMPOP42166 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TMPOP42166 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TMPOP42166 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TMPOP42166 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TMPOP42166 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TMPOP42166 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TMPOP42166 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TMPOP42166 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TMPOP42166 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TMPOP42166 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TMPOP42166 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TMPOP42166 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TMPOP42166 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TMPOP42166 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TMPOP42166 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TMPOP42166 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TMPOP42166 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TMPOP42166 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.12□□□□□ -2.75
TMPOP42166 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TMPOP42166 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TMPOP42166 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TMPOP42166 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TMPOP42166 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TMPOP42166 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TMPOP42166 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TMPOP42166 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
TMPOP42166 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TMPOP42166 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TMPOP42166 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TMPOP42166 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TMPOP42166 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TMPOP42166 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TMPOP42166 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TMPOP42166 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
TMPOP42166 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TMPOP42166 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
TMPOP42166 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TMPOP42166 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TMPOP42166 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TMPOP42166 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TMPOP42166 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TMPOP42166 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TMPOP42166 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TMPOP42166 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TMPOP42166 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TMPOP42166 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TMPOP42166 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TMPOP42166 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TMPOP42166 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TMPOP42166 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TMPOP42166 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TMPOP42166 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TMPOP42166 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TMPOP42166 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TMPOP42166 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TMPOP42166 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TMPOP42166 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TMPOP42166 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TMPOP42166 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TMPOP42166 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TMPOP42166 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TMPOP42166 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TMPOP42166 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TMPOP42166 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TMPOP42166 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TMPOP42166 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
TMPOP42166 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TMPOP42166 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
TMPOP42166 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
TMPOP42166 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
TMPOP42166 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
TMPOP42166 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
TMPOP42166 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
TMPOP42166 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TMPOP42166 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TMPOP42166 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TMPOP42166 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TMPOP42166 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TMPOP42166 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
TMPOP42166 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TMPOP42166 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TMPOP42166 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
TMPOP42166 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TMPOP42166 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TMPOP42166 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TMPOP42166 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TMPOP42166 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TMPOP42166 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TMPOP42166 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TMPOP42166 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
TMPOP42166 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms