Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHHQ15465 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHHQ15465 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SHHQ15465 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SHHQ15465 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SHHQ15465 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SHHQ15465 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SHHQ15465 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SHHQ15465 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHHQ15465 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHHQ15465 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHHQ15465 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHHQ15465 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHHQ15465 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SHHQ15465 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SHHQ15465 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SHHQ15465 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SHHQ15465 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SHHQ15465 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SHHQ15465 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SHHQ15465 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SHHQ15465 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SHHQ15465 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHHQ15465 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SHHQ15465 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SHHQ15465 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SHHQ15465 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SHHQ15465 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SHHQ15465 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SHHQ15465 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SHHQ15465 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SHHQ15465 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHHQ15465 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHHQ15465 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SHHQ15465 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SHHQ15465 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SHHQ15465 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHHQ15465 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHHQ15465 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHHQ15465 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHHQ15465 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHHQ15465 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHHQ15465 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHHQ15465 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHHQ15465 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHHQ15465 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHHQ15465 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHHQ15465 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SHHQ15465 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHHQ15465 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHHQ15465 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHHQ15465 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHHQ15465 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHHQ15465 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHHQ15465 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHHQ15465 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHHQ15465 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHHQ15465 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHHQ15465 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHHQ15465 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SHHQ15465 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SHHQ15465 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SHHQ15465 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SHHQ15465 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SHHQ15465 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SHHQ15465 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SHHQ15465 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SHHQ15465 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SHHQ15465 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SHHQ15465 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SHHQ15465 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SHHQ15465 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SHHQ15465 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SHHQ15465 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SHHQ15465 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SHHQ15465 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SHHQ15465 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SHHQ15465 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SHHQ15465 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SHHQ15465 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SHHQ15465 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SHHQ15465 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SHHQ15465 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SHHQ15465 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SHHQ15465 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SHHQ15465 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
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SHHQ15465 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SHHQ15465 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SHHQ15465 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SHHQ15465 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHHQ15465 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHHQ15465 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHHQ15465 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SHHQ15465 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHHQ15465 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHHQ15465 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHHQ15465 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHHQ15465 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHHQ15465 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
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