Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXE3Q13461 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXE3Q13461 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXE3Q13461 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXE3Q13461 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXE3Q13461 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXE3Q13461 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXE3Q13461 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXE3Q13461 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXE3Q13461 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
FOXE3Q13461 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
FOXE3Q13461 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
FOXE3Q13461 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
FOXE3Q13461 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
FOXE3Q13461 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
FOXE3Q13461 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
FOXE3Q13461 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXE3Q13461 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXE3Q13461 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXE3Q13461 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXE3Q13461 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXE3Q13461 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXE3Q13461 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
FOXE3Q13461 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
FOXE3Q13461 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
FOXE3Q13461 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
FOXE3Q13461 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
FOXE3Q13461 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXE3Q13461 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXE3Q13461 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXE3Q13461 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXE3Q13461 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXE3Q13461 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXE3Q13461 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXE3Q13461 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXE3Q13461 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXE3Q13461 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXE3Q13461 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
FOXE3Q13461 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXE3Q13461 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXE3Q13461 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXE3Q13461 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXE3Q13461 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXE3Q13461 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXE3Q13461 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXE3Q13461 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXE3Q13461 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXE3Q13461 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXE3Q13461 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXE3Q13461 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXE3Q13461 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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FOXE3Q13461 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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FOXE3Q13461 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
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FOXE3Q13461 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
FOXE3Q13461 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
FOXE3Q13461 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
FOXE3Q13461 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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FOXE3Q13461 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
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FOXE3Q13461 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXE3Q13461 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
FOXE3Q13461 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
FOXE3Q13461 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
FOXE3Q13461 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
FOXE3Q13461 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
FOXE3Q13461 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
FOXE3Q13461 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
FOXE3Q13461 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
FOXE3Q13461 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
FOXE3Q13461 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
FOXE3Q13461 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
FOXE3Q13461 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
FOXE3Q13461 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
FOXE3Q13461 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
FOXE3Q13461 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
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