Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
RIGQ13278 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
RIGQ13278 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RIGQ13278 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RIGQ13278 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RIGQ13278 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RIGQ13278 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
RIGQ13278 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
RIGQ13278 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
RIGQ13278 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
RIGQ13278 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RIGQ13278 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RIGQ13278 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RIGQ13278 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RIGQ13278 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RIGQ13278 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RIGQ13278 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RIGQ13278 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RIGQ13278 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RIGQ13278 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RIGQ13278 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RIGQ13278 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RIGQ13278 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
RIGQ13278 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
RIGQ13278 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
RIGQ13278 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RIGQ13278 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
RIGQ13278 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
RIGQ13278 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
RIGQ13278 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
RIGQ13278 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
RIGQ13278 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
RIGQ13278 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
RIGQ13278 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
RIGQ13278 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
RIGQ13278 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
RIGQ13278 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RIGQ13278 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RIGQ13278 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RIGQ13278 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RIGQ13278 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
RIGQ13278 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
RIGQ13278 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
RIGQ13278 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RIGQ13278 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RIGQ13278 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RIGQ13278 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RIGQ13278 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RIGQ13278 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RIGQ13278 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RIGQ13278 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RIGQ13278 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RIGQ13278 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RIGQ13278 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RIGQ13278 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RIGQ13278 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RIGQ13278 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RIGQ13278 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RIGQ13278 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RIGQ13278 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RIGQ13278 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RIGQ13278 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RIGQ13278 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RIGQ13278 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RIGQ13278 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RIGQ13278 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RIGQ13278 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RIGQ13278 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RIGQ13278 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RIGQ13278 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RIGQ13278 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RIGQ13278 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RIGQ13278 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RIGQ13278 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RIGQ13278 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RIGQ13278 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RIGQ13278 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RIGQ13278 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RIGQ13278 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RIGQ13278 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RIGQ13278 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
RIGQ13278 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RIGQ13278 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RIGQ13278 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RIGQ13278 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
RIGQ13278 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
RIGQ13278 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
RIGQ13278 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.44□□□□□ -2.64
RIGQ13278 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
RIGQ13278 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
RIGQ13278 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
RIGQ13278 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
RIGQ13278 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
RIGQ13278 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
RIGQ13278 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
RIGQ13278 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
RIGQ13278 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
RIGQ13278 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
RIGQ13278 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
RIGQ13278 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
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