Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
GPS1Q13098 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
GPS1Q13098 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
GPS1Q13098 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
GPS1Q13098 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
GPS1Q13098 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
GPS1Q13098 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
GPS1Q13098 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
GPS1Q13098 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
GPS1Q13098 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
GPS1Q13098 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
GPS1Q13098 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
GPS1Q13098 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
GPS1Q13098 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
GPS1Q13098 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
GPS1Q13098 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
GPS1Q13098 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
GPS1Q13098 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
GPS1Q13098 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
GPS1Q13098 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
GPS1Q13098 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
GPS1Q13098 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
GPS1Q13098 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
GPS1Q13098 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
GPS1Q13098 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
GPS1Q13098 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
GPS1Q13098 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
GPS1Q13098 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
GPS1Q13098 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
GPS1Q13098 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
GPS1Q13098 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
GPS1Q13098 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
GPS1Q13098 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
GPS1Q13098 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
GPS1Q13098 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
GPS1Q13098 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
GPS1Q13098 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
GPS1Q13098 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
GPS1Q13098 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
GPS1Q13098 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
GPS1Q13098 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
GPS1Q13098 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
GPS1Q13098 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
GPS1Q13098 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
GPS1Q13098 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
GPS1Q13098 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
GPS1Q13098 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
GPS1Q13098 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
GPS1Q13098 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
GPS1Q13098 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
GPS1Q13098 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
GPS1Q13098 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
GPS1Q13098 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
GPS1Q13098 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
GPS1Q13098 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
GPS1Q13098 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
GPS1Q13098 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
GPS1Q13098 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
GPS1Q13098 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
GPS1Q13098 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
GPS1Q13098 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
GPS1Q13098 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
GPS1Q13098 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
GPS1Q13098 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
GPS1Q13098 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
GPS1Q13098 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
GPS1Q13098 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
GPS1Q13098 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
GPS1Q13098 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
GPS1Q13098 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
GPS1Q13098 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
GPS1Q13098 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
GPS1Q13098 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
GPS1Q13098 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
GPS1Q13098 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
GPS1Q13098 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
GPS1Q13098 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
GPS1Q13098 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
GPS1Q13098 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
GPS1Q13098 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
GPS1Q13098 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
GPS1Q13098 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
GPS1Q13098 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
GPS1Q13098 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
GPS1Q13098 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
GPS1Q13098 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
GPS1Q13098 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
GPS1Q13098 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
GPS1Q13098 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
GPS1Q13098 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
GPS1Q13098 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.34□□□□□ -2.78
GPS1Q13098 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
GPS1Q13098 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
GPS1Q13098 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
GPS1Q13098 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
GPS1Q13098 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
GPS1Q13098 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
GPS1Q13098 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
GPS1Q13098 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GPS1Q13098 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 310 ms