Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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FOXC1Q12948 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
FOXC1Q12948 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
FOXC1Q12948 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
FOXC1Q12948 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
FOXC1Q12948 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
FOXC1Q12948 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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FOXC1Q12948 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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FOXC1Q12948 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
FOXC1Q12948 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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FOXC1Q12948 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXC1Q12948 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXC1Q12948 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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FOXC1Q12948 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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FOXC1Q12948 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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FOXC1Q12948 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXC1Q12948 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXC1Q12948 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXC1Q12948 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FOXC1Q12948 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FOXC1Q12948 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
FOXC1Q12948 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
FOXC1Q12948 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
FOXC1Q12948 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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FOXC1Q12948 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
FOXC1Q12948 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
FOXC1Q12948 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
FOXC1Q12948 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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FOXC1Q12948 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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FOXC1Q12948 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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FOXC1Q12948 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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FOXC1Q12948 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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FOXC1Q12948 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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FOXC1Q12948 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXC1Q12948 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
FOXC1Q12948 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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